77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3955 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3955  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 152 aa  309  7.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.038977  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0678  cyclase/dehydrase  74.83 
 
 		 148 aa  245  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2685  cyclase/dehydrase  75.51 
 
 		 149 aa  242  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3431  cyclase/dehydrase  75.51 
 
 		 149 aa  242  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0199  cyclase/dehydrase  69.18 
 
 		 151 aa  223  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3177  cyclase/dehydrase  71.13 
 
 		 151 aa  219  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4789  cyclase/dehydrase  64.14 
 
 		 147 aa  211  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.799233  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1511  hypothetical protein  69.5 
 
 		 145 aa  211  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.399595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0336  hypothetical protein  46.48 
 
 		 146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2355  hypothetical protein  48.59 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26201  putative integral membrane protein  45.77 
 
 		 149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.52339 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01301  putative integral membrane protein  36.77 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.561031 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1483  putative integral membrane protein  39.04 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.77346  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01881  putative integral membrane protein  38.36 
 
 		 150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.560201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01281  putative integral membrane protein  37.67 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.49008  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0117  putative integral membrane protein  34.93 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01311  putative integral membrane protein  34.93 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01321  putative integral membrane protein  34.93 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37514  predicted protein  31.69 
 
 		 153 aa  94  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.458024 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43619  predicted protein  32.43 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3412  cyclase/dehydrase  28.17 
 
 		 337 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1527  cyclase/dehydrase  28.03 
 
 		 181 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.626943  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1044  cyclase/dehydrase  28.87 
 
 		 272 aa  60.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214991  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3785  cyclase/dehydrase  27.74 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1018  cyclase/dehydrase  27.27 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.665706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0307  cyclase/dehydrase  25.93 
 
 		 303 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1003  cyclase/dehydrase  26.87 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109283  decreased coverage  0.00240737 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1754  cyclase/dehydrase  23.65 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0957  cyclase/dehydrase  26.52 
 
 		 170 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1015  cyclase/dehydrase  27.27 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0343567  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2623  cyclase/dehydrase  27.21 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.502552 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3967  cyclase/dehydrase  25.35 
 
 		 300 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2639  cyclase/dehydrase  24.24 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.697167  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0413  hypothetical protein  27.78 
 
 		 231 aa  53.9  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.239427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3678  cyclase/dehydrase  27.82 
 
 		 216 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2865  cyclase/dehydrase  26.52 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0007  cyclase/dehydrase  27.27 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5344  cyclase/dehydrase  27.82 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0812  cyclase/dehydrase  25.62 
 
 		 217 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5444  cyclase/dehydrase  27.46 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252579  normal  0.482853 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1322  cyclase/dehydrase  27.59 
 
 		 237 aa  50.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4497  cyclase/dehydrase  27.21 
 
 		 232 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7248  integral membrane protein-like protein  23.48 
 
 		 232 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0123  cyclase/dehydrase  23.88 
 
 		 243 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.764786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0825  cyclase/dehydrase  23.24 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.987427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3009  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 256 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149284 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1740  cyclase/dehydrase  22.38 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  decreased coverage  0.000862073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15860  polyketide cyclase / dehydrase family protein  24.63 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00215892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0297  cyclase/dehydrase  25.76 
 
 		 210 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0103  cyclase/dehydrase  21.13 
 
 		 203 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3665  cyclase/dehydrase  19.7 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.961718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1801  cyclase/dehydrase  23.91 
 
 		 205 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11048  predicted protein  32.14 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3216  cyclase/dehydrase  28.95 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0140  cyclase/dehydrase  24.46 
 
 		 242 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0114  cyclase/dehydrase  25.69 
 
 		 225 aa  47.4  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1111  cyclase/dehydrase  25.87 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0994  cyclase/dehydrase  25.74 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3832  cyclase/dehydrase  29.06 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3433  cyclase/dehydrase  26.83 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151513  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3103  hypothetical protein  29.06 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3684  cyclase/dehydrase  27.7 
 
 		 219 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  25.19 
 
 		 328 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0577  cyclase/dehydrase  24.14 
 
 		 241 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1407  cyclase/dehydrase  28.74 
 
 		 197 aa  44.3  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1350  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 238 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2872  hypothetical protein  21.74 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4270  Polyketide cyclase/dehydrase  40 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  0.925027 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2916  cyclase/dehydrase  21.74 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2654  cyclase/dehydrase  24.32 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2902  cyclase/dehydrase  21.74 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2801  cyclase/dehydrase  21.83 
 
 		 145 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0725635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2976  Polyketide cyclase/dehydrase  39.53 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4557  cyclase/dehydrase  54.55 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.091151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4853  cyclase/dehydrase  54.55 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592845  normal  0.0606758 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4470  hypothetical protein  54.55 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0659  cyclase/dehydrase  28.41 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.913891  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>