10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0596 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0596  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 138 aa  277  3e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1384  hypothetical protein  28.69 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00709714  hitchhiker  0.0000401191 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0207  hypothetical protein  25.76 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1059  hypothetical protein  25.36 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000123116  hitchhiker  0.0000000473128 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2116  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1568  hypothetical protein  20.74 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2853  cyclase/dehydrase  25.9 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1450  hypothetical protein  23.53 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00351642  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1229  hypothetical protein  23.89 
 
 		 217 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323968  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1252  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 148 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000133913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>