161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2501 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 135 aa  267  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  90.98 
 
 		 134 aa  219  8e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1085  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.68 
 
 		 168 aa  160  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  58.7 
 
 		 150 aa  158  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  60.5 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2392  cupin 2 domain-containing protein  57.02 
 
 		 140 aa  140  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2852  cupin 2  55.28 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.47 
 
 		 294 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0147  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.78 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  35.56 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.82 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  28.83 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  34.34 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  34.18 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  27.91 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.07 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  30.21 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3023  cupin 2, barrel  45.83 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  31.87 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  43.33 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3325  mannose-6-phosphate isomerase, type II  37.5 
 
 		 448 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.321079 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  31.76 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.73 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.99 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4617  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  33.01 
 
 		 469 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0274196  normal  0.929739 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.46 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3175  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.1 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.46 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  30.99 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  26.09 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  26.09 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3499  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.1 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4503  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.04 
 
 		 469 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.930228  normal  0.622419 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  26.09 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3065  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  36.92 
 
 		 450 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.861502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.45 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  26.09 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  35.19 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4135  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.04 
 
 		 469 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.500124  normal  0.71949 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  26.09 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.07 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  26.09 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  26.09 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  26.09 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  27.91 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  26.09 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  32.88 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  38.36 
 
 		 332 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1043  cupin 2 domain-containing protein  30.85 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18490  mannose-6-phosphate isomerase  30.93 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.151918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1734  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  35.09 
 
 		 455 aa  44.7  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1314  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  31.15 
 
 		 476 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.79469  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3192  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.77 
 
 		 486 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.764858  normal  0.047158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3745  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.81 
 
 		 478 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.824016 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  29.46 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  25 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0737  cupin 2 domain-containing protein  27.35 
 
 		 207 aa  44.3  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13701  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  28.12 
 
 		 480 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1633  cupin 2 domain-containing protein  29.9 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 202 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1259  cupin family protein  30 
 
 		 418 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0758699  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2575  cupin family protein  30 
 
 		 418 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0231  oxalate decarboxylase  30 
 
 		 418 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.842819  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0503  oxalate decarboxylase  30 
 
 		 418 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1413  oxalate decarboxylase  30 
 
 		 418 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00642683  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1331  oxalate decarboxylase  30 
 
 		 418 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1067  oxalate decarboxylase  30 
 
 		 418 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209096  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1129  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  34.38 
 
 		 514 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.511007 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6494  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  33.85 
 
 		 514 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.91925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3181  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.31 
 
 		 462 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.825175  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  36.84 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0773  cupin 2 protein  33.33 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.707426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1303  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  33.85 
 
 		 470 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2782  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  33.85 
 
 		 470 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 311 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.3 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08099  oxalate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14610)  28.57 
 
 		 477 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  0.0552946 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3304  signal peptide protein  36.92 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0282721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1595  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  31.25 
 
 		 470 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163975 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4578  cupin 2 domain-containing protein  36.76 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2079  Mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  30.77 
 
 		 488 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02481  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  29.23 
 
 		 469 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  28.41 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2475  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  33.87 
 
 		 505 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21987 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.59 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  24.32 
 
 		 121 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18380  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.31 
 
 		 481 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.126788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  29.03 
 
 		 134 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.93 
 
 		 133 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>