136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8561 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 140 aa  288  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  31.13 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  35.45 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.19 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  30.36 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  30.97 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  34.88 
 
 		 372 aa  53.9  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  40.85 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  31.93 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.81 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3674  cupin 2 domain-containing protein  27.52 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.206207  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  31.51 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.44 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0937  hypothetical protein  31.93 
 
 		 170 aa  51.2  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.34 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  31.88 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.88 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  30.7 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1915  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  33.33 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.82 
 
 		 118 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  28.7 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  36.36 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.84 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.28 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5139  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.18 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.96 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.62 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  34.33 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  31.67 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  26.42 
 
 		 129 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  35.94 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.99 
 
 		 421 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.47 
 
 		 364 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  28.75 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  39.13 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4146  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.5 
 
 		 474 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.469733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3001  cupin 2 domain-containing protein  28.71 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  39.44 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.96 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  39.39 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  32.31 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1523  mannose-6-phosphate isomerase type II  29.33 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.51 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1496  mannose-6-phosphate isomerase type II  29.33 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  30.34 
 
 		 177 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  35.94 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.33 
 
 		 274 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4778  cupin 2 domain-containing protein  29.69 
 
 		 350 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4794  cupin 2 domain-containing protein  36.76 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3023  cupin 2, barrel  33.87 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  37.1 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1167  cupin 2 domain-containing protein  28.7 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168838 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6791  cupin 2 domain-containing protein  36.76 
 
 		 136 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.399896 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  26.37 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2662  cupin 2 domain-containing protein  32.81 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3518  cupin 2 domain-containing protein  29.73 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  27.54 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.63 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  26.04 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.14 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.93 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  37.5 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  31.11 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0548  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.91 
 
 		 480 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.753424  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  29.85 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0402  bicupin, oxalate decarboxylase family  35.14 
 
 		 404 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.14 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0371  bicupin, oxalate decarboxylase family  35.14 
 
 		 404 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0091  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.13 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.18498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1085  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2073  cupin 2, barrel  29.03 
 
 		 156 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.607152 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  27.66 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26031  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  32.5 
 
 		 484 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.941841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.81 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  32.39 
 
 		 120 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3499  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.94 
 
 		 161 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0347  Mannose-1-phosphate guanylyltransferase  36.73 
 
 		 476 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0544  hypothetical protein, putative phage gene  31.34 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597495  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.87 
 
 		 172 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0396  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 		 145 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.337758  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0708  Nucleotidyl transferase  36 
 
 		 334 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.509912  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4993  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28 
 
 		 137 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3175  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.94 
 
 		 161 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  36.36 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2483  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  34.18 
 
 		 496 aa  41.2  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1324  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  26.19 
 
 		 476 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  33.33 
 
 		 332 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2273  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1044  methionine--tRNA ligase  38.1 
 
 		 671 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  29.85 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  35.21 
 
 		 370 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>