91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1041 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 311 aa  633    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.27 
 
 		 166 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  36.78 
 
 		 114 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 149 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  32.73 
 
 		 160 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  32.73 
 
 		 160 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.71 
 
 		 111 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  32.73 
 
 		 153 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  32.73 
 
 		 153 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.86 
 
 		 118 aa  50.4  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.33 
 
 		 138 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 182 aa  49.7  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2044  hypothetical protein  30.11 
 
 		 128 aa  49.7  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 123 aa  49.3  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  36.49 
 
 		 157 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  46 
 
 		 197 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.69 
 
 		 133 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1387  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  23.89 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00099914  normal  0.234758 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  28.23 
 
 		 179 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2140  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.53 
 
 		 121 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  31.82 
 
 		 160 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6135  hypothetical protein  27.45 
 
 		 155 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.715074  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  38.6 
 
 		 182 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 182 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4272  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.85 
 
 		 149 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 182 aa  47.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 182 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  38.6 
 
 		 182 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 165 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  45.16 
 
 		 191 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.1 
 
 		 153 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471134  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  31.82 
 
 		 153 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 		 192 aa  47  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 208 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2366  transcriptional regulator, XRE family  34.04 
 
 		 184 aa  46.6  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 208 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 208 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  38.6 
 
 		 182 aa  46.6  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  38.71 
 
 		 134 aa  46.6  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0812  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.18 
 
 		 91 aa  46.2  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000379382  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.62 
 
 		 117 aa  46.6  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 183 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  36.23 
 
 		 111 aa  46.2  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.59 
 
 		 113 aa  46.2  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69980  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 182 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3869  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 183 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2799  hypothetical protein  33.85 
 
 		 104 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7832900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0105  DNA-binding protein  40.35 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  33.75 
 
 		 150 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 123 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5005  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 255 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4297  cupin 2 domain-containing protein  35.21 
 
 		 144 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 		 190 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  33.77 
 
 		 106 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.35 
 
 		 199 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1443  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 182 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 104 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 182 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2400  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 127 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0766  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 183 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  31.48 
 
 		 124 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  36.76 
 
 		 133 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0016  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose- 6-phosphate isomerase  37.5 
 
 		 447 aa  43.9  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6075  putative transcriptional regulator  36.21 
 
 		 182 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  28.74 
 
 		 117 aa  44.3  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 197 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  26.61 
 
 		 143 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 182 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3161  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 182 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4834  transcriptional regulator, XRE family  30.28 
 
 		 182 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197047  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.3 
 
 		 121 aa  43.5  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3674  cupin 2 domain-containing protein  29.47 
 
 		 131 aa  43.5  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.206207  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 182 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 135 aa  43.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0895  cupin 2 domain-containing protein  30.38 
 
 		 125 aa  43.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 199 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 182 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0147  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.29 
 
 		 141 aa  42.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 201 aa  43.1  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  35.14 
 
 		 163 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1167  cupin 2 domain-containing protein  27.78 
 
 		 152 aa  42.7  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168838 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 234 aa  42.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.73 
 
 		 121 aa  42.7  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  27.38 
 
 		 115 aa  42.7  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3738  cupin 2 domain-containing protein  37.04 
 
 		 281 aa  42.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.250553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 182 aa  42.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 255 aa  42.4  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 182 aa  42.4  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47950  Cupin, RmlC-type protein  35.19 
 
 		 182 aa  42.4  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>