60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1285 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1285  cupin region  100 
 
 		 113 aa  233  6e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.46 
 
 		 103 aa  107  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  34.52 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.48 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  40.3 
 
 		 155 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  34.74 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1270  hypothetical protein  33.71 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  40.3 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.55 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  37.68 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  38.71 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  36.23 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  36.23 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  36.23 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  31.43 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  35.94 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  36.23 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.12 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  35.16 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  30.34 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  33.75 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.38 
 
 		 257 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  26.98 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2200  hypothetical protein  39.68 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.192403 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  28.26 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2173  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  32.5 
 
 		 471 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0774935  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  33.75 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1115  cupin 2 domain-containing protein  32.22 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.378995 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.18 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.67 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1177  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.06 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  35.62 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 292 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  34.85 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  34.85 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  34.85 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.23 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.15 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  34.85 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  33.75 
 
 		 115 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2919  hypothetical protein  28.81 
 
 		 114 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000876891  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.23 
 
 		 159 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  36.23 
 
 		 154 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  30.36 
 
 		 203 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.37 
 
 		 172 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  27.78 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1791  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose- 6-phosphate isomerase  26.32 
 
 		 443 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0056  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28.57 
 
 		 467 aa  40.4  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10784  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  30.77 
 
 		 155 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1660  Mannose-6-phosphate isomerase  27.85 
 
 		 117 aa  40.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2662  cupin 2 domain-containing protein  29.51 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4317  polyketide synthesis domain protein  27.47 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3181  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  39.06 
 
 		 462 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.825175  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.37 
 
 		 172 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2503  cupin 2, barrel  29.23 
 
 		 202 aa  40  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01258  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  29.58 
 
 		 172 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>