49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2075 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2075  cupin region  100 
 
 		 135 aa  280  6.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2361  cupin 2 protein  73.85 
 
 		 130 aa  206  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.877822  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0905  cupin 2 domain-containing protein  59.23 
 
 		 133 aa  159  9e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.52502  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1364  hypothetical protein  53.79 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  51.52 
 
 		 132 aa  137  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1654  hypothetical protein  51.49 
 
 		 134 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225443  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3262  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  42.97 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.232764  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0005  YrkC  43.7 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.4 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1073  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.98 
 
 		 175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000222691  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0006  YrkC  43.8 
 
 		 167 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.49 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5567  cupin 2 domain-containing protein  45.9 
 
 		 201 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495662 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2503  cupin 2, barrel  43.8 
 
 		 202 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01258  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.15 
 
 		 186 aa  103  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  40.94 
 
 		 177 aa  101  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  45.37 
 
 		 130 aa  100  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2716  cupin domain protein  38.02 
 
 		 190 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00607762  normal  0.0576252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  46.15 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06210  mannose-6-phosphate isomerase  37.9 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2607  cupin domain protein  38.02 
 
 		 190 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2328  cupin region  39.64 
 
 		 167 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3146  cupin 2, barrel  36.04 
 
 		 187 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.515896 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  37.27 
 
 		 203 aa  80.1  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.48 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2906  hypothetical protein  29.13 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.808157  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.64 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1285  cupin region  35.16 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1738  cupin 2, barrel  30.86 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.39391  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.51 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0564  hypothetical protein  31.11 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  30.34 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.07 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  27.18 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.23 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.72 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0523242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  40.79 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3512  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.72 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.47 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.08 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2443  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  27.27 
 
 		 450 aa  41.6  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  37.5 
 
 		 167 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.4 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.37 
 
 		 126 aa  40.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  30 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2044  hypothetical protein  27.03 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  31.67 
 
 		 119 aa  40  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  37.74 
 
 		 166 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>