31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_C0006 on replicon NC_011771
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011771  BCAH820_C0006  YrkC  100 
 
 
167 aa  351  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0005  YrkC  97.01 
 
 
182 aa  343  7e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5567  cupin 2 domain-containing protein  86.23 
 
 
201 aa  304  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0495662 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  80.84 
 
 
186 aa  286  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2503  cupin 2, barrel  76.34 
 
 
202 aa  219  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2716  cupin domain protein  73.28 
 
 
190 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00607762  normal  0.0576252 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2607  cupin domain protein  70.9 
 
 
190 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1073  Cupin 2 conserved barrel domain protein  70.23 
 
 
175 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000222691  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06210  mannose-6-phosphate isomerase  53.08 
 
 
140 aa  155  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2328  cupin region  54.17 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3146  cupin 2, barrel  50 
 
 
187 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.515896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3262  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  52.89 
 
 
129 aa  143  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.232764  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2361  cupin 2 protein  43.09 
 
 
130 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.877822  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  43.8 
 
 
135 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  42.86 
 
 
132 aa  100  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1364  hypothetical protein  40.98 
 
 
135 aa  98.2  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0905  cupin 2 domain-containing protein  37.4 
 
 
133 aa  93.2  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.52502  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.83 
 
 
130 aa  91.3  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  40.87 
 
 
130 aa  89.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  40.87 
 
 
130 aa  88.6  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.87 
 
 
133 aa  88.6  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1654  hypothetical protein  38.79 
 
 
134 aa  82.4  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225443  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  38.74 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  31.15 
 
 
203 aa  58.9  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2691  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.77 
 
 
501 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0450701 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17301  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  24.43 
 
 
482 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.686235  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2267  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  27.47 
 
 
472 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6271  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  29.27 
 
 
477 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1314  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  25.96 
 
 
476 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.79469  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0820  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30 
 
 
465 aa  40.8  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0737  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  29.27 
 
 
474 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.848743  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>