28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1738 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1738  cupin 2, barrel  100 
 
 		 112 aa  226  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.39391  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1207  cupin 2 domain-containing protein  75.89 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3665  hypothetical protein  59.46 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  64.65 
 
 		 112 aa  137  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1690  hypothetical protein  62.5 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0136157 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1054  cupin family protein  50 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  41.67 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  38.04 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2799  hypothetical protein  36.9 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7832900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08490  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.04 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  30.95 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  30.86 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  35.9 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.49 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  28.74 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2831  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.17 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.17 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1439  cupin 2 domain-containing protein  31.33 
 
 		 199 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.83171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 179 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  31.43 
 
 		 179 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1073  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.36 
 
 		 175 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000222691  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.61 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2919  hypothetical protein  31.67 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000876891  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.84 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.81 
 
 		 110 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.81 
 
 		 110 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>