48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2286 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 130 aa  266  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  87.6 
 
 		 130 aa  205  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  70.31 
 
 		 130 aa  194  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  75 
 
 		 133 aa  186  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  52.31 
 
 		 177 aa  138  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  50.44 
 
 		 203 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0905  cupin 2 domain-containing protein  47.32 
 
 		 133 aa  110  9e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.52502  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1364  hypothetical protein  48.08 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06210  mannose-6-phosphate isomerase  43.12 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  44.95 
 
 		 135 aa  100  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  47 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2328  cupin region  48.45 
 
 		 167 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3262  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  48.65 
 
 		 129 aa  97.8  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.232764  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1654  hypothetical protein  41.18 
 
 		 134 aa  97.1  7e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225443  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3146  cupin 2, barrel  40.17 
 
 		 187 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.515896 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2361  cupin 2 protein  47.71 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.877822  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0005  YrkC  41.88 
 
 		 182 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1073  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.79 
 
 		 175 aa  94.7  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000222691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.03 
 
 		 186 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2503  cupin 2, barrel  38.94 
 
 		 202 aa  92.8  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01258  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0006  YrkC  41.59 
 
 		 167 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5567  cupin 2 domain-containing protein  38.84 
 
 		 201 aa  89.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495662 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2716  cupin domain protein  38.21 
 
 		 190 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00607762  normal  0.0576252 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2607  cupin domain protein  38.52 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  34.15 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.62 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  26.74 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.75 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  32.53 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10260  cupin domain-containing protein  29.11 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.227794 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1285  cupin region  33.75 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0544  hypothetical protein, putative phage gene  25.58 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597495  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  31.43 
 
 		 114 aa  43.5  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2852  cupin 2  32.2 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.37 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0523242  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01933  Mannose-1-phosphate guanylyltransferase  25.88 
 
 		 474 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01920  hypothetical protein  25.88 
 
 		 474 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3512  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.37 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 115 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  30.67 
 
 		 134 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  26.83 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  31.43 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.72 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1523  mannose-6-phosphate isomerase type II  27.27 
 
 		 126 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0413  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.14 
 
 		 480 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1496  mannose-6-phosphate isomerase type II  27.27 
 
 		 126 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>