28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_C0005 on replicon NC_011771
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011771  BCAH820_C0005  YrkC  100 
 
 
182 aa  381  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0006  YrkC  97.01 
 
 
167 aa  343  8e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5567  cupin 2 domain-containing protein  85.16 
 
 
201 aa  324  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0495662 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  81.66 
 
 
186 aa  290  6e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2503  cupin 2, barrel  75.57 
 
 
202 aa  218  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2716  cupin domain protein  72.93 
 
 
190 aa  214  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00607762  normal  0.0576252 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2607  cupin domain protein  70.59 
 
 
190 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1073  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.67 
 
 
175 aa  202  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000222691  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06210  mannose-6-phosphate isomerase  52.31 
 
 
140 aa  155  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2328  cupin region  54.17 
 
 
167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3146  cupin 2, barrel  50 
 
 
187 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.515896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3262  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  52.85 
 
 
129 aa  143  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.232764  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2361  cupin 2 protein  44.53 
 
 
130 aa  123  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.877822  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  43.7 
 
 
135 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1364  hypothetical protein  42.64 
 
 
135 aa  104  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  44.54 
 
 
132 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0905  cupin 2 domain-containing protein  38.76 
 
 
133 aa  99.8  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.52502  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.65 
 
 
130 aa  96.7  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  40.87 
 
 
130 aa  92  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  42.11 
 
 
130 aa  91.3  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.87 
 
 
133 aa  90.5  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1654  hypothetical protein  40.48 
 
 
134 aa  85.9  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225443  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  37.61 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  31.5 
 
 
203 aa  61.2  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17301  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  23.12 
 
 
482 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.686235  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2691  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28.57 
 
 
501 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0450701 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6271  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28.05 
 
 
477 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2267  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  26.37 
 
 
472 aa  41.2  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>