74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0266 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 130 aa  265  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  80.16 
 
 		 133 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  72.66 
 
 		 130 aa  177  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  70.31 
 
 		 130 aa  174  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  57.72 
 
 		 177 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  57.52 
 
 		 203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0905  cupin 2 domain-containing protein  47.01 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.52502  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  52.43 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  42.4 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1654  hypothetical protein  44.64 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225443  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1364  hypothetical protein  50.45 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06210  mannose-6-phosphate isomerase  43.08 
 
 		 140 aa  110  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2361  cupin 2 protein  45.3 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.877822  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2503  cupin 2, barrel  38.98 
 
 		 202 aa  100  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01258  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1073  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.4 
 
 		 175 aa  100  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000222691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.98 
 
 		 186 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0005  YrkC  40.65 
 
 		 182 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2328  cupin region  41.82 
 
 		 167 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3146  cupin 2, barrel  38.94 
 
 		 187 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.515896 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0006  YrkC  39.83 
 
 		 167 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5567  cupin 2 domain-containing protein  36.59 
 
 		 201 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495662 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3262  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  41.44 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.232764  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2716  cupin domain protein  33.87 
 
 		 190 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00607762  normal  0.0576252 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2607  cupin domain protein  34.68 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.24 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.36 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10260  cupin domain-containing protein  37.97 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.227794 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  31.33 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1285  cupin region  35.48 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1043  cupin 2 domain-containing protein  38.98 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.88 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  38.46 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  30.38 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.43 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0544  hypothetical protein, putative phage gene  30.56 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597495  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2619  cupin 2, barrel  32.67 
 
 		 120 aa  47.4  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  31.51 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.21 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0523242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3512  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.21 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  30.26 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  28.99 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  32.88 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4993  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.47 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.63 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_003296  RS03110  hypothetical protein  27.37 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.050196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  27.94 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0028  double-stranded beta-helix-like protein  31.17 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.4 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  33.33 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.43 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.79 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1523  mannose-6-phosphate isomerase type II  30 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2906  hypothetical protein  24.39 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.808157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  30 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2136  hypothetical protein  30.77 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.0212795 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0564  hypothetical protein  25.93 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2644  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  29.87 
 
 		 475 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.789787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1496  mannose-6-phosphate isomerase type II  30 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  24.74 
 
 		 146 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.63 
 
 		 133 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  32.2 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0495  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  29.87 
 
 		 460 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  31.33 
 
 		 115 aa  40.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1646  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2044  hypothetical protein  34.85 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2053  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1329  mannose-6-phosphate isomerase  26.76 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0501  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3325  mannose-6-phosphate isomerase type II  24.56 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.51 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 150 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3324  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 110 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>