45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4993 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4993  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
137 aa  280  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391501  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5854  cupin 2 domain-containing protein  81.75 
 
 
137 aa  238  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.06 
 
 
146 aa  135  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  45.38 
 
 
135 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  33.67 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  25 
 
 
129 aa  55.1  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  34.44 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 
134 aa  50.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3109  cupin region  32.95 
 
 
175 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  32.48 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3867  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468547  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2388  oxalate decarboxylase  25.53 
 
 
389 aa  45.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.72 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.47 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 
115 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.52 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3657  cupin 2, barrel  26.5 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.87 
 
 
421 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  27.97 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2328  cupin region  29.11 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0200  oxalate decarboxylase  28.05 
 
 
378 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  28.05 
 
 
658 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.66 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2053  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.81 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2183  bicupin, oxalate decarboxylase family  26.13 
 
 
384 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1043  cupin 2 domain-containing protein  28.7 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2503  cupin 2, barrel  31.25 
 
 
202 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01258  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  33.78 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.34 
 
 
138 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28 
 
 
140 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  29.67 
 
 
148 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0402  bicupin, oxalate decarboxylase family  25.47 
 
 
404 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3674  cupin 2 domain-containing protein  29.06 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.206207  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  31.33 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.46 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5567  cupin 2 domain-containing protein  29.69 
 
 
201 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0495662 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08099  oxalate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14610)  30.49 
 
 
477 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  0.0552946 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.7 
 
 
172 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0737  cupin 2 domain-containing protein  28.97 
 
 
207 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.33 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.24 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.68 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0371  bicupin, oxalate decarboxylase family  25.47 
 
 
404 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571775  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.09 
 
 
294 aa  40  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>