35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2044 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2044  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  258  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  41.11 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.76 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.47 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2831  cupin 2 domain-containing protein  36.9 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.56 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0445  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.205887 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.26 
 
 
153 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471134  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6135  hypothetical protein  47.27 
 
 
155 aa  50.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.715074  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  30.11 
 
 
311 aa  49.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.45 
 
 
186 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3262  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  31.52 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.232764  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.99 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  38.98 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 
192 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.68 
 
 
204 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.68 
 
 
204 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  38.89 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2711  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.85 
 
 
319 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  35.71 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.51 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  38.36 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 
118 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1917  hypothetical protein  38.36 
 
 
172 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2031  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.38 
 
 
478 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0272076  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0895  cupin 2 domain-containing protein  27.47 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.94 
 
 
182 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  36 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  27.03 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.07 
 
 
163 aa  40.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.85 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  36.36 
 
 
203 aa  40.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.4 
 
 
421 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>