64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0895 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0895  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 125 aa  260  4e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2400  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.29 
 
 		 127 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  42.28 
 
 		 123 aa  98.6  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  32.52 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.6 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.68 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  26.21 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.63 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.21 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1351  cupin 2 domain-containing protein  30.85 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00886277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1335  cupin 2 domain-containing protein  30.85 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568302  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.66 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1883  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.88 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1633  cupin 2 domain-containing protein  30.68 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  29.49 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.3 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1167  cupin 2 domain-containing protein  30.08 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168838 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1730  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  30.11 
 
 		 507 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0687231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3192  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.56 
 
 		 486 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.764858  normal  0.047158 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0330  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.56 
 
 		 491 aa  45.1  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00801876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1299  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  31.34 
 
 		 454 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3325  mannose-6-phosphate isomerase, type II  30.84 
 
 		 448 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.321079 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4186  mannose-6-phosphate isomerase, type II  27.84 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5005  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.63 
 
 		 255 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1580  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  33.87 
 
 		 458 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.492771  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  30.38 
 
 		 311 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  28.21 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.86 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  32.47 
 
 		 111 aa  42.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0790  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.39 
 
 		 477 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.916465  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5608  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  29.17 
 
 		 469 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.58 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0685  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  32.39 
 
 		 477 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1090  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  29.85 
 
 		 508 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.69906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.99 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1243  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.42 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.99 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  31.51 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2845  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose- 6-phosphate isomerase  26.87 
 
 		 456 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1129  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  31.34 
 
 		 514 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.511007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6135  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.715074  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35570  hypothetical protein  30 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467993  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6494  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  31.34 
 
 		 514 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.91925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 111 aa  40.8  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04818  cupin domain  25.81 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2044  hypothetical protein  27.47 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0332  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.26 
 
 		 458 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.174943  hitchhiker  0.000174576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.91 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471134  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3098  cupin 2 domain-containing protein  32.69 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0926795 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0901  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  26.67 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.554615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.67 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  39.13 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  39.13 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18490  mannose-6-phosphate isomerase  29.03 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.151918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2000  hypothetical protein  28.72 
 
 		 156 aa  40  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5139  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  28.89 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2852  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  33.82 
 
 		 476 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>