90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1435 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 122 aa  252  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  54.46 
 
 		 117 aa  126  9.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.31 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.92 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.87 
 
 		 133 aa  99.8  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.28 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.47 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  41.98 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.05 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  37.63 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1335  cupin 2 domain-containing protein  37.21 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568302  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1351  cupin 2 domain-containing protein  37.21 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00886277  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1633  cupin 2 domain-containing protein  30.53 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2400  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.13 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1386  cupin 2 domain-containing protein  38.2 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0895  cupin 2 domain-containing protein  23.21 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1167  cupin 2 domain-containing protein  35.85 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168838 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  32.05 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  28.87 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.99 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  35.11 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.67 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01320  hypothetical protein  29.46 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333196  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.25 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.82 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1883  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.19 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.62 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.61 
 
 		 192 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5098  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.52 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0517  cupin 2 domain-containing protein  30.85 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6135  hypothetical protein  41.07 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.715074  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1350  cupin 2 domain-containing protein  32.04 
 
 		 287 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.832765  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  29.7 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  45.65 
 
 		 177 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  27.4 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  33.87 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  23.48 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.88 
 
 		 181 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  29.11 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  29.31 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  35.48 
 
 		 155 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.75 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471134  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.63 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.332449  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.76 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0468  cupin 2 domain-containing protein  33.01 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0932  cupin 2 domain-containing protein  27.18 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.62 
 
 		 389 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.89 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  29.76 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3065  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  34.38 
 
 		 450 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.861502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  29.2 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.26 
 
 		 204 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1690  hypothetical protein  22.12 
 
 		 118 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0136157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3867  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.21 
 
 		 145 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  38.33 
 
 		 109 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0330  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.11 
 
 		 491 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00801876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  28.26 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2487  hypothetical protein  29.09 
 
 		 278 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0929015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.18 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3200  hypothetical protein  29.25 
 
 		 289 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228169  normal  0.637752 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3530  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3175  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.58 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  32.35 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.26 
 
 		 204 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3499  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.58 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2396  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.74 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  28.74 
 
 		 311 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  32.32 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1387  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  29.29 
 
 		 249 aa  40.8  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00099914  normal  0.234758 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2799  hypothetical protein  29.23 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7832900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4820  hypothetical protein  36.36 
 
 		 141 aa  40.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0707469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2243  hypothetical protein  28.57 
 
 		 311 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6771  hypothetical protein  27.71 
 
 		 248 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.42 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  25.61 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.7 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 234 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0495  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.05 
 
 		 460 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.48 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2135  cupin 2 domain-containing protein  30.49 
 
 		 100 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.769565  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0625  hypothetical protein  34.29 
 
 		 166 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.92 
 
 		 111 aa  40  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>