24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4820 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4820  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  275  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0707469  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1913  hypothetical protein  89.36 
 
 
141 aa  222  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.421142  normal  0.261472 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3421  cupin 2 domain-containing protein  33.8 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.357216  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1171  hypothetical protein  34.03 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1347  hypothetical protein  31.79 
 
 
176 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835036  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3026  cupin 2 domain-containing protein  32.91 
 
 
176 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1938  hypothetical protein  43.1 
 
 
191 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.73761  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05730  hypothetical protein  27.08 
 
 
179 aa  52  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.26234  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06743  hydrolase, CocE/NonD family, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00600)  37.76 
 
 
793 aa  52  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0144437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3537  cupin 2, barrel  27.49 
 
 
193 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.579632  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5492  transcriptional regulator protein  44.07 
 
 
193 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2395  cupin 2 domain-containing protein  44.07 
 
 
192 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162048  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3204  hypothetical protein  55.81 
 
 
195 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5607  cupin 2 domain-containing protein  48.44 
 
 
183 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3987  cupin 2 domain-containing protein  26.35 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.966145  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1200  cupin 2 domain-containing protein  45.57 
 
 
183 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.375289  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07635  Putative uncharacterized proteinPutative uncharacterized protein binA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74707]  39.06 
 
 
144 aa  47  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.837301  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3139  cupin 2 domain-containing protein  38.33 
 
 
192 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5297  cupin 2 domain-containing protein  28.32 
 
 
183 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4825  cupin 2 domain-containing protein  38.98 
 
 
198 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1555  hypothetical protein  33.9 
 
 
179 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1682  hypothetical protein  26.32 
 
 
186 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.557508  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  39.06 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 
122 aa  40.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>