29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1171 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1171  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  333  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1938  hypothetical protein  28.65 
 
 		 191 aa  70.9  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.73761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1347  hypothetical protein  31.03 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835036  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2395  cupin 2 domain-containing protein  28.98 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3987  cupin 2 domain-containing protein  29.94 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.966145  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4820  hypothetical protein  34.03 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0707469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5607  cupin 2 domain-containing protein  31.28 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5297  cupin 2 domain-containing protein  24.56 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4825  cupin 2 domain-containing protein  26.9 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4799  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.49808  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3421  cupin 2 domain-containing protein  27.66 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.357216  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3204  hypothetical protein  29.34 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1913  hypothetical protein  34.69 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.421142  normal  0.261472 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3026  cupin 2 domain-containing protein  42.47 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4528  cupin 2 domain-containing protein  26.9 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.42906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1200  cupin 2 domain-containing protein  43.24 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.375289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3537  cupin 2, barrel  42.31 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.579632  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06743  hydrolase, CocE/NonD family, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00600)  50.98 
 
 		 793 aa  52.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0144437 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1682  hypothetical protein  25.66 
 
 		 186 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.557508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3139  cupin 2 domain-containing protein  22.22 
 
 		 192 aa  51.6  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1555  hypothetical protein  26.45 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3009  hypothetical protein  41.38 
 
 		 241 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5492  transcriptional regulator protein  33.33 
 
 		 193 aa  48.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07635  Putative uncharacterized proteinPutative uncharacterized protein binA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74707]  31.76 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.837301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1709  transcriptional regulator, XRE family  36.47 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  35.48 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 193 aa  40.8  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05730  hypothetical protein  26.55 
 
 		 179 aa  40.8  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.26234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1127  hypothetical protein  31.34 
 
 		 120 aa  40.8  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.332513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>