27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1350 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1350  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 287 aa  568  1e-161  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.832765  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  27.38 
 
 		 120 aa  52.4  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.18 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  34.57 
 
 		 163 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1757  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.6 
 
 		 125 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01320  hypothetical protein  36.25 
 
 		 122 aa  49.3  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333196  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  32.63 
 
 		 177 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.62 
 
 		 118 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  32.26 
 
 		 171 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0577  hypothetical protein  37.35 
 
 		 125 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116523  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  37.31 
 
 		 163 aa  46.6  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  29.36 
 
 		 122 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  32.05 
 
 		 137 aa  46.2  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.04 
 
 		 122 aa  45.8  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 152 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  32.1 
 
 		 117 aa  45.4  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.26 
 
 		 152 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0347  Mannose-1-phosphate guanylyltransferase  26.61 
 
 		 476 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 160 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.61 
 
 		 119 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1270  hypothetical protein  32.86 
 
 		 140 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 		 192 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  32.22 
 
 		 190 aa  43.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  31.75 
 
 		 172 aa  42.7  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 171 aa  42.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  36.62 
 
 		 153 aa  42.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.44 
 
 		 136 aa  42  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>