50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0577 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0577  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  256  9e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116523  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.85 
 
 		 122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.332449  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01320  hypothetical protein  61.54 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333196  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  45.78 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.98 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.51 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  44.3 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  39.76 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.23 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  40.23 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  35.44 
 
 		 120 aa  50.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1757  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.75 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1622  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 		 374 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  35.53 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.64 
 
 		 332 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  35.79 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  40.85 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1646  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.62 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1350  cupin 2 domain-containing protein  37.35 
 
 		 287 aa  47.8  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.832765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3001  cupin 2 domain-containing protein  33.04 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.38 
 
 		 372 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0160035  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3273  methionyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 662 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  31.71 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  36.84 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  38.03 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  30.56 
 
 		 396 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  30.11 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6318  Methionine--tRNA ligase  38.89 
 
 		 662 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0788  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.62 
 
 		 114 aa  42.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0985  oxalate decarboxylase  30.61 
 
 		 405 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  34.38 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  37.5 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.13 
 
 		 421 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 		 369 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  30.48 
 
 		 123 aa  42  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04818  cupin domain  30.85 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  33.33 
 
 		 332 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  42.86 
 
 		 191 aa  41.2  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1329  mannose-6-phosphate isomerase  26.92 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0501  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  28.24 
 
 		 171 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  22.89 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1693  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 396 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  25 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  24.53 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3065  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  31.75 
 
 		 450 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.861502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2678  bicupin, oxalate decarboxylase family  28.57 
 
 		 418 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 146 aa  40.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  32.73 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>