More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2973 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 
274 aa  565  1e-160  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1123  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  72.34 
 
 
147 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1204  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  72.34 
 
 
143 aa  219  3e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4937  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  70.21 
 
 
143 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0889323 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1816  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  70.92 
 
 
144 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468453  normal  0.80703 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1414  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  69.5 
 
 
143 aa  214  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276842  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0498  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  70.29 
 
 
139 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0144132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0485  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  70.29 
 
 
139 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5742  Cytosine deaminase  64.54 
 
 
144 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0824  cytosine deaminase  70.29 
 
 
140 aa  187  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.385917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1635  cytosine deaminase  56.64 
 
 
145 aa  177  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.503034  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1483  Cytosine deaminase  53.47 
 
 
146 aa  172  5e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1480  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.17 
 
 
145 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1786  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.03 
 
 
145 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315123  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4158  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.56 
 
 
160 aa  169  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0945  cytosine deaminase  54.42 
 
 
177 aa  168  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353729  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3086  cytosine deaminase  55.24 
 
 
145 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1290  Cytosine deaminase  55.24 
 
 
145 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.589706 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0117  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.61 
 
 
145 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.515188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2798  cytosine deaminase  53.85 
 
 
145 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3077  cytosine deaminase  55.24 
 
 
145 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1397  cytosine deaminase  54.55 
 
 
145 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0051  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.23 
 
 
146 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2881  cytosine deaminase  53.85 
 
 
145 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2977  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.85 
 
 
145 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0677  cytosine deaminase  55.32 
 
 
145 aa  165  8e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3229  cytosine deaminase  55.24 
 
 
145 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.17 
 
 
145 aa  163  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1204  cytosine deaminase  53.15 
 
 
145 aa  162  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1307  cytosine deaminase  52.78 
 
 
145 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2506  cytosine deaminase  51.75 
 
 
149 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0043356  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1602  cytosine deaminase  53.85 
 
 
145 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0907  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  52.45 
 
 
146 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.459324  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2556  cytosine deaminase  51.03 
 
 
149 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1980  cytosine deaminase  50.69 
 
 
145 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.597926  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3869  cytosine deaminase  51.05 
 
 
145 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0725206  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3776  cytosine deaminase  52.45 
 
 
145 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.650074  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3606  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.68 
 
 
154 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241267  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3601  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  51.68 
 
 
154 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00422327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3674  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.68 
 
 
154 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1318  hypothetical protein  49.3 
 
 
151 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.49 
 
 
160 aa  152  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.43 
 
 
164 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2579  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50 
 
 
146 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2066  Cytosine deaminase  46.26 
 
 
165 aa  148  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3461  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.71 
 
 
150 aa  148  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4144  cytosine deaminase  48.28 
 
 
154 aa  145  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0892  cytosine deaminase  53.6 
 
 
176 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78481  cytosine deaminase  45.27 
 
 
150 aa  143  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.701177  normal  0.798696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1435  Cytosine deaminase  46.21 
 
 
153 aa  142  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.317365  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04267  cytosine deaminase  49.29 
 
 
151 aa  141  9e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205672  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00990  cytosine/adenosine deaminase  43.05 
 
 
175 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0864  Cytosine deaminase  43.8 
 
 
165 aa  128  9.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5409  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.29 
 
 
158 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.210093  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1757  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.15 
 
 
125 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128793  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05950  cytosine deaminase, putative  37.97 
 
 
165 aa  113  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275444  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.94 
 
 
119 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  47.17 
 
 
122 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.79 
 
 
174 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.76 
 
 
148 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.28 
 
 
175 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.28 
 
 
175 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.93 
 
 
164 aa  93.2  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.86 
 
 
156 aa  92.4  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.67 
 
 
189 aa  91.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  39.62 
 
 
163 aa  90.9  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.34 
 
 
175 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  35.86 
 
 
182 aa  90.5  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  34.48 
 
 
168 aa  90.1  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1819  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein, putative  37.09 
 
 
172 aa  90.1  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000174201  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  42.72 
 
 
161 aa  89.7  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  43.52 
 
 
148 aa  89.7  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  43.52 
 
 
148 aa  89.7  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0501  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.5 
 
 
149 aa  89.4  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  42.74 
 
 
150 aa  88.6  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.51 
 
 
154 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  45.54 
 
 
171 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4304  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.89 
 
 
160 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0110494  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.32 
 
 
158 aa  87  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  42.99 
 
 
190 aa  87  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0400  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  44.66 
 
 
168 aa  87  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000750433  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  35.86 
 
 
152 aa  87  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  42.99 
 
 
222 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.58 
 
 
166 aa  86.7  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1229  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.47 
 
 
156 aa  86.7  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.64 
 
 
168 aa  86.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.87 
 
 
475 aa  85.5  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.14 
 
 
150 aa  85.5  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.906022  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.1 
 
 
151 aa  85.5  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  43.88 
 
 
159 aa  85.1  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.18 
 
 
142 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0174432  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  40.57 
 
 
193 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.45 
 
 
484 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  38.02 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  38.02 
 
 
187 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.12 
 
 
160 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.62 
 
 
169 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.26 
 
 
181 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  30.5 
 
 
143 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  38.02 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>