More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2381 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 		 145 aa  293  5e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4158  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  79.31 
 
 		 160 aa  244  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1602  cytosine deaminase  79.86 
 
 		 145 aa  243  8e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1480  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  80 
 
 		 145 aa  242  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1980  cytosine deaminase  78.62 
 
 		 145 aa  242  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.597926  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3869  cytosine deaminase  77.08 
 
 		 145 aa  241  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0725206  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3776  cytosine deaminase  76.39 
 
 		 145 aa  236  8e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.650074  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2506  cytosine deaminase  74.31 
 
 		 149 aa  221  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0043356  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0907  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  72.22 
 
 		 146 aa  220  6e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.459324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1483  Cytosine deaminase  68.97 
 
 		 146 aa  213  8e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0117  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  67.36 
 
 		 145 aa  212  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.515188 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1786  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  66.67 
 
 		 145 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315123  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1635  cytosine deaminase  65.28 
 
 		 145 aa  208  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.503034  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2798  cytosine deaminase  65.97 
 
 		 145 aa  206  6e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1397  cytosine deaminase  66.67 
 
 		 145 aa  206  8e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2881  cytosine deaminase  65.97 
 
 		 145 aa  206  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2977  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  65.97 
 
 		 145 aa  206  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0677  cytosine deaminase  65.28 
 
 		 145 aa  205  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0051  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.5 
 
 		 146 aa  203  6e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1307  cytosine deaminase  69.66 
 
 		 145 aa  202  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1290  Cytosine deaminase  63.19 
 
 		 145 aa  201  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.589706 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3086  cytosine deaminase  63.19 
 
 		 145 aa  201  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1204  cytosine deaminase  64.58 
 
 		 145 aa  201  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3077  cytosine deaminase  63.19 
 
 		 145 aa  201  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3229  cytosine deaminase  62.5 
 
 		 145 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4144  cytosine deaminase  68.12 
 
 		 154 aa  197  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1318  hypothetical protein  62.94 
 
 		 151 aa  194  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2556  cytosine deaminase  63.19 
 
 		 149 aa  192  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0945  cytosine deaminase  64.19 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353729  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00990  cytosine/adenosine deaminase  62.68 
 
 		 175 aa  191  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1435  Cytosine deaminase  59.44 
 
 		 153 aa  186  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.317365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0864  Cytosine deaminase  61.81 
 
 		 165 aa  185  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78481  cytosine deaminase  58.87 
 
 		 150 aa  170  5.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.701177  normal  0.798696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5742  Cytosine deaminase  53.47 
 
 		 144 aa  168  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1816  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.86 
 
 		 144 aa  166  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468453  normal  0.80703 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1204  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.39 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.17 
 
 		 274 aa  163  8e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1414  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  52.78 
 
 		 143 aa  161  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276842  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1123  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.39 
 
 		 147 aa  159  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0892  cytosine deaminase  58.59 
 
 		 176 aa  157  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.03 
 
 		 160 aa  156  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4937  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  50 
 
 		 143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0889323 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0485  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.43 
 
 		 139 aa  153  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0498  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.43 
 
 		 139 aa  153  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0144132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2579  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.41 
 
 		 146 aa  144  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3461  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.95 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.3 
 
 		 164 aa  145  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3674  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.55 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3606  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.55 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241267  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3601  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  47.55 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00422327  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05950  cytosine deaminase, putative  49.31 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275444  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04267  cytosine deaminase  47.55 
 
 		 151 aa  137  7e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205672  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2066  Cytosine deaminase  45.07 
 
 		 165 aa  131  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0824  cytosine deaminase  52.86 
 
 		 140 aa  123  9e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.385917  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5409  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.15 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.210093  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0501  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1819  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein, putative  35.9 
 
 		 172 aa  88.6  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000174201  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0400  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.59 
 
 		 168 aa  87.8  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000750433  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1229  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.43 
 
 		 156 aa  87.8  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3893  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.46 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  35.17 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.26 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.96 
 
 		 181 aa  84.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  47.92 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  44.68 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.36 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.32 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.94 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.37 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.24 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0019  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  40.5 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0510921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0024  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  40.5 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000145543  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  39.67 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.736614  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  39.67 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0020  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  39.67 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  39.67 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  39.67 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125537  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.66 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  33.33 
 
 		 149 aa  80.1  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  43.75 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.67 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.67 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  42.27 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.67 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.41 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0274  tRNA-adenosine deaminase  43 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  36.11 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  42.72 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4222  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.09 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  36.11 
 
 		 177 aa  77.4  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5296  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  38.02 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000172102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4304  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.16 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0110494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.44 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.44 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.19 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0616301  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  43.16 
 
 		 164 aa  76.6  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.81 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.906022  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.24 
 
 		 166 aa  76.6  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1525  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.43 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  42.11 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>