More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4937 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4937  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  100 
 
 
143 aa  298  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0889323 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1414  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  85.31 
 
 
143 aa  259  8.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276842  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1123  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  80.99 
 
 
147 aa  246  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0485  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  79.71 
 
 
139 aa  234  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0498  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  79.71 
 
 
139 aa  234  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0144132 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1816  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  74.83 
 
 
144 aa  230  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468453  normal  0.80703 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1204  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  74.13 
 
 
143 aa  225  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  70.21 
 
 
274 aa  216  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5742  Cytosine deaminase  65.49 
 
 
144 aa  205  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0824  cytosine deaminase  68.84 
 
 
140 aa  183  6e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.385917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1635  cytosine deaminase  58.33 
 
 
145 aa  179  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.503034  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2798  cytosine deaminase  59.72 
 
 
145 aa  177  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2881  cytosine deaminase  59.72 
 
 
145 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1397  cytosine deaminase  59.03 
 
 
145 aa  176  9e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1290  Cytosine deaminase  59.72 
 
 
145 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.589706 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3086  cytosine deaminase  59.72 
 
 
145 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2977  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  59.03 
 
 
145 aa  176  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2556  cytosine deaminase  55.94 
 
 
149 aa  175  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3229  cytosine deaminase  59.72 
 
 
145 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1483  Cytosine deaminase  56.25 
 
 
146 aa  175  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3077  cytosine deaminase  59.72 
 
 
145 aa  174  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1204  cytosine deaminase  59.03 
 
 
145 aa  174  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0117  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.86 
 
 
145 aa  169  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.515188 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1786  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.17 
 
 
145 aa  168  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315123  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4158  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.56 
 
 
160 aa  167  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0051  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.86 
 
 
146 aa  167  5e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1307  cytosine deaminase  54.17 
 
 
145 aa  166  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0945  cytosine deaminase  52.7 
 
 
177 aa  164  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353729  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0677  cytosine deaminase  52.08 
 
 
145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3869  cytosine deaminase  53.47 
 
 
145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0725206  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3606  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.32 
 
 
154 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241267  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3601  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  55.32 
 
 
154 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00422327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3674  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.32 
 
 
154 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3776  cytosine deaminase  52.78 
 
 
145 aa  161  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.650074  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1480  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.47 
 
 
145 aa  161  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1980  cytosine deaminase  52.08 
 
 
145 aa  160  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.597926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1602  cytosine deaminase  53.47 
 
 
145 aa  158  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1318  hypothetical protein  50.35 
 
 
151 aa  157  5e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2579  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.77 
 
 
146 aa  156  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0907  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50.69 
 
 
146 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.459324  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.77 
 
 
164 aa  154  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3461  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.43 
 
 
150 aa  150  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.16 
 
 
160 aa  149  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2066  Cytosine deaminase  48.23 
 
 
165 aa  147  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4144  cytosine deaminase  47.55 
 
 
154 aa  146  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5409  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.3 
 
 
158 aa  145  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.210093  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2506  cytosine deaminase  47.22 
 
 
149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0043356  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04267  cytosine deaminase  50.71 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205672  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78481  cytosine deaminase  48.94 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.701177  normal  0.798696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0892  cytosine deaminase  50.39 
 
 
176 aa  141  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1435  Cytosine deaminase  45.77 
 
 
153 aa  135  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.317365  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00990  cytosine/adenosine deaminase  41.84 
 
 
175 aa  129  9e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0864  Cytosine deaminase  39.31 
 
 
165 aa  120  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05950  cytosine deaminase, putative  38.89 
 
 
165 aa  113  8.999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275444  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.01 
 
 
156 aa  101  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.41 
 
 
175 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.67 
 
 
164 aa  98.6  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.85 
 
 
175 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.41 
 
 
175 aa  97.4  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.41 
 
 
174 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  40.6 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2788  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.03 
 
 
158 aa  94.4  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0654304  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  32.37 
 
 
143 aa  94  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4304  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.29 
 
 
160 aa  94  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0110494  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  32.37 
 
 
143 aa  94  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.86 
 
 
177 aa  93.6  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  40 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.57 
 
 
160 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.59 
 
 
176 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  39.84 
 
 
168 aa  92  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.57 
 
 
151 aa  92  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  37.67 
 
 
222 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.29 
 
 
162 aa  91.3  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.32 
 
 
189 aa  90.9  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35 
 
 
169 aa  90.5  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3440  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.21 
 
 
152 aa  90.5  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1229  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.51 
 
 
156 aa  90.1  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  38.6 
 
 
163 aa  90.1  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  46.32 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0325  tRNA-adenosine deaminase  38.57 
 
 
170 aa  89.7  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00296157  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  46.32 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  37.14 
 
 
182 aa  89.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  35.21 
 
 
193 aa  89.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0400  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.57 
 
 
168 aa  89  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000750433  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.06 
 
 
484 aa  89  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.36 
 
 
157 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1315  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.68 
 
 
163 aa  89.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.847285  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  45.1 
 
 
164 aa  88.6  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.14 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0174432  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.37 
 
 
170 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.43 
 
 
165 aa  88.2  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.65 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  34.29 
 
 
161 aa  87.8  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.17 
 
 
148 aa  87.8  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.76 
 
 
181 aa  87.4  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  36.81 
 
 
176 aa  87.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.72 
 
 
159 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.36 
 
 
168 aa  87.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  40.17 
 
 
166 aa  87.4  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>