More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0179 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
160 aa  328  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0892  cytosine deaminase  87.69 
 
 
176 aa  239  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5742  Cytosine deaminase  58.27 
 
 
144 aa  177  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4158  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56.64 
 
 
160 aa  174  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3606  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56.67 
 
 
154 aa  170  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241267  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3601  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  56.67 
 
 
154 aa  170  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00422327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3674  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56.67 
 
 
154 aa  170  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3869  cytosine deaminase  53.9 
 
 
145 aa  166  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0725206  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.79 
 
 
164 aa  166  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1318  hypothetical protein  53.96 
 
 
151 aa  165  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1480  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.57 
 
 
145 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1816  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.52 
 
 
144 aa  163  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468453  normal  0.80703 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1414  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  49.65 
 
 
143 aa  162  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276842  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1980  cytosine deaminase  55 
 
 
145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.597926  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.85 
 
 
145 aa  161  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2579  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.79 
 
 
146 aa  160  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.67 
 
 
274 aa  160  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3776  cytosine deaminase  50.69 
 
 
145 aa  158  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.650074  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0485  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.92 
 
 
139 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0498  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.92 
 
 
139 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0144132 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1204  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.08 
 
 
143 aa  157  8e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1123  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.89 
 
 
147 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3461  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.45 
 
 
150 aa  155  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1602  cytosine deaminase  52.48 
 
 
145 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0907  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  54.29 
 
 
146 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.459324  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0945  cytosine deaminase  47.92 
 
 
177 aa  152  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353729  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4937  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  49.28 
 
 
143 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0889323 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0117  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.35 
 
 
145 aa  151  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.515188 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1635  cytosine deaminase  48.23 
 
 
145 aa  151  4e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.503034  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0051  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.52 
 
 
146 aa  149  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04267  cytosine deaminase  51.43 
 
 
151 aa  149  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205672  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2556  cytosine deaminase  54.74 
 
 
149 aa  147  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00990  cytosine/adenosine deaminase  48.34 
 
 
175 aa  147  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0677  cytosine deaminase  48.94 
 
 
145 aa  147  6e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1435  Cytosine deaminase  55.71 
 
 
153 aa  147  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.317365  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4144  cytosine deaminase  53.1 
 
 
154 aa  147  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1786  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.65 
 
 
145 aa  147  6e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315123  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1483  Cytosine deaminase  47.86 
 
 
146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1307  cytosine deaminase  51.43 
 
 
145 aa  145  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2798  cytosine deaminase  48.23 
 
 
145 aa  145  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2881  cytosine deaminase  48.23 
 
 
145 aa  144  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1397  cytosine deaminase  48.23 
 
 
145 aa  143  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2506  cytosine deaminase  48.23 
 
 
149 aa  143  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0043356  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2977  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.52 
 
 
145 aa  142  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2066  Cytosine deaminase  46.31 
 
 
165 aa  140  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1204  cytosine deaminase  46.81 
 
 
145 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1290  Cytosine deaminase  45.32 
 
 
145 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.589706 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3086  cytosine deaminase  45.32 
 
 
145 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78481  cytosine deaminase  45.58 
 
 
150 aa  137  4.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.701177  normal  0.798696 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3077  cytosine deaminase  45.32 
 
 
145 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3229  cytosine deaminase  45.32 
 
 
145 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0864  Cytosine deaminase  50.72 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0824  cytosine deaminase  50.7 
 
 
140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.385917  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5409  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.64 
 
 
158 aa  124  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.210093  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05950  cytosine deaminase, putative  42.76 
 
 
165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275444  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  42.42 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.36 
 
 
174 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  40.71 
 
 
222 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.48 
 
 
181 aa  88.2  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.36 
 
 
175 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.45 
 
 
166 aa  87.4  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.36 
 
 
175 aa  87.4  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.56 
 
 
189 aa  87.4  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  46.46 
 
 
148 aa  87  9e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  46.46 
 
 
148 aa  87  9e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  52.5 
 
 
190 aa  87  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  41.13 
 
 
167 aa  87  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.3 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  40 
 
 
166 aa  85.1  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.33 
 
 
175 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.45 
 
 
166 aa  84.7  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.44 
 
 
361 aa  84.3  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.44 
 
 
361 aa  84.3  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.16 
 
 
164 aa  84  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  48.28 
 
 
154 aa  84  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1236  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.469544  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1307  tRNA-adenosine deaminase  50 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1315  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.13 
 
 
163 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.847285  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  45.74 
 
 
177 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  41 
 
 
193 aa  82  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  42.86 
 
 
182 aa  82  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.23 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0174432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.71 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.98 
 
 
169 aa  82  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3291  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  48.72 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  42.16 
 
 
163 aa  80.9  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.27 
 
 
475 aa  80.9  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.42 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  41.41 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.86 
 
 
162 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.23 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  43 
 
 
177 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  42.72 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.96 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1229  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.91 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  45.65 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.43 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  36.07 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>