More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA05950 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA05950  cytosine deaminase, putative  100 
 
 
165 aa  341  2.9999999999999997e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275444  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1602  cytosine deaminase  51.03 
 
 
145 aa  151  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3776  cytosine deaminase  51.03 
 
 
145 aa  151  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.650074  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1786  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.74 
 
 
145 aa  148  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315123  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0117  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.42 
 
 
145 aa  148  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.515188 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0677  cytosine deaminase  52.05 
 
 
145 aa  145  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78481  cytosine deaminase  49.31 
 
 
150 aa  142  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.701177  normal  0.798696 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4144  cytosine deaminase  49.31 
 
 
154 aa  141  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1318  hypothetical protein  48.67 
 
 
151 aa  140  8e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1435  Cytosine deaminase  45.86 
 
 
153 aa  139  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.317365  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3869  cytosine deaminase  49.66 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0725206  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1480  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.31 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4158  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.61 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1980  cytosine deaminase  49.31 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.597926  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.31 
 
 
145 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0945  cytosine deaminase  50.72 
 
 
177 aa  137  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353729  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2506  cytosine deaminase  47.65 
 
 
149 aa  137  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0043356  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00990  cytosine/adenosine deaminase  46.31 
 
 
175 aa  135  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0051  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.58 
 
 
146 aa  135  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1635  cytosine deaminase  46.9 
 
 
145 aa  134  5e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.503034  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1397  cytosine deaminase  45.21 
 
 
145 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3086  cytosine deaminase  45.52 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2556  cytosine deaminase  46.9 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1290  Cytosine deaminase  45.52 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.589706 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2798  cytosine deaminase  44.83 
 
 
145 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2881  cytosine deaminase  44.52 
 
 
145 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3077  cytosine deaminase  45.89 
 
 
145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3229  cytosine deaminase  45.52 
 
 
145 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1204  cytosine deaminase  46.26 
 
 
145 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2977  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.83 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5742  Cytosine deaminase  45.21 
 
 
144 aa  128  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0864  Cytosine deaminase  43.15 
 
 
165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0907  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  44.44 
 
 
146 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.459324  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1483  Cytosine deaminase  43.06 
 
 
146 aa  122  3e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1816  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.1 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468453  normal  0.80703 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1307  cytosine deaminase  43.75 
 
 
145 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1123  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3461  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.28 
 
 
150 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4937  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  38.89 
 
 
143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0889323 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.97 
 
 
274 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04267  cytosine deaminase  42.95 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205672  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0485  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.5 
 
 
139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1204  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.93 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0498  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.5 
 
 
139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0144132 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1414  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.76 
 
 
143 aa  106  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276842  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.48 
 
 
164 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.12 
 
 
160 aa  104  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2579  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.18 
 
 
146 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3606  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.71 
 
 
154 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241267  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3601  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  38.71 
 
 
154 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00422327  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0892  cytosine deaminase  42.22 
 
 
176 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3674  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.71 
 
 
154 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0824  cytosine deaminase  42.76 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.385917  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2066  Cytosine deaminase  38.26 
 
 
165 aa  96.7  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5409  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.89 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.210093  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1819  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein, putative  37.1 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000174201  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0231  hypothetical protein  30.33 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4304  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.85 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0110494  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0109  cytosine/adenosine deaminase  36.63 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4222  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.3 
 
 
157 aa  62.4  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1229  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.58 
 
 
156 aa  62  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0501  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.36 
 
 
149 aa  61.2  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0498  cytosine deaminase, putative  26.87 
 
 
153 aa  61.6  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.490204 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  35.79 
 
 
168 aa  61.2  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.67 
 
 
156 aa  61.2  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.67 
 
 
156 aa  61.2  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.67 
 
 
150 aa  60.8  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.906022  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  29.25 
 
 
177 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  30.25 
 
 
189 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1413  tRNA-adenosine deaminase  26.9 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0325  tRNA-adenosine deaminase  31.21 
 
 
170 aa  58.9  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00296157  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  30.56 
 
 
151 aa  58.9  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2788  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.43 
 
 
158 aa  58.9  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0654304  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  26.49 
 
 
150 aa  58.5  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0400  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  31.9 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000750433  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1071  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.03 
 
 
187 aa  58.5  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.45442  normal  0.648956 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_7195  predicted protein  28.7 
 
 
160 aa  58.5  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0624  tRNA-adenosine deaminase  25.19 
 
 
153 aa  58.2  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0190  cytosine deaminase, putative  27.41 
 
 
153 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.68 
 
 
161 aa  57.4  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3893  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
161 aa  57.4  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.1 
 
 
148 aa  57.4  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  34.48 
 
 
151 aa  57.4  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  31.96 
 
 
165 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.19 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  28.95 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0668  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.19 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  27.83 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1315  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.18 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.847285  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0274  tRNA-adenosine deaminase  32.26 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  31.43 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  31.62 
 
 
190 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0777  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  24.44 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.69 
 
 
160 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1856  tRNA-adenosine deaminase  24.39 
 
 
168 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.489212  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  27.39 
 
 
150 aa  55.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.08 
 
 
174 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  31 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  34.74 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.36 
 
 
175 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>