More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0907 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0907  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  100 
 
 		 146 aa  302  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.459324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4158  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  75 
 
 		 160 aa  229  9e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1480  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  71.53 
 
 		 145 aa  223  9e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  72.22 
 
 		 145 aa  220  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1602  cytosine deaminase  70.14 
 
 		 145 aa  218  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3776  cytosine deaminase  69.44 
 
 		 145 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.650074  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1980  cytosine deaminase  69.44 
 
 		 145 aa  214  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.597926  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3869  cytosine deaminase  67.36 
 
 		 145 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0725206  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1483  Cytosine deaminase  68.06 
 
 		 146 aa  211  3.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2506  cytosine deaminase  64.58 
 
 		 149 aa  203  7e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0043356  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0117  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  61.11 
 
 		 145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.515188 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1786  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.42 
 
 		 145 aa  197  3e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315123  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1635  cytosine deaminase  60.42 
 
 		 145 aa  196  7.999999999999999e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.503034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1290  Cytosine deaminase  62.5 
 
 		 145 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.589706 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3086  cytosine deaminase  62.5 
 
 		 145 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3229  cytosine deaminase  62.5 
 
 		 145 aa  194  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2881  cytosine deaminase  63.19 
 
 		 145 aa  194  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3077  cytosine deaminase  61.81 
 
 		 145 aa  193  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2798  cytosine deaminase  63.19 
 
 		 145 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1204  cytosine deaminase  63.19 
 
 		 145 aa  193  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0677  cytosine deaminase  59.72 
 
 		 145 aa  193  6e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1397  cytosine deaminase  62.5 
 
 		 145 aa  193  7e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1307  cytosine deaminase  66.67 
 
 		 145 aa  192  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2977  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  63.19 
 
 		 145 aa  192  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0051  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.79 
 
 		 146 aa  189  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0945  cytosine deaminase  60.67 
 
 		 177 aa  186  8e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353729  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1318  hypothetical protein  58.22 
 
 		 151 aa  184  5e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4144  cytosine deaminase  62.94 
 
 		 154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00990  cytosine/adenosine deaminase  57.34 
 
 		 175 aa  175  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2556  cytosine deaminase  57.34 
 
 		 149 aa  172  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78481  cytosine deaminase  57.45 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.701177  normal  0.798696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0864  Cytosine deaminase  56.64 
 
 		 165 aa  169  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1435  Cytosine deaminase  58.16 
 
 		 153 aa  166  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.317365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1816  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.78 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468453  normal  0.80703 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1123  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.03 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.45 
 
 		 274 aa  159  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0485  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.43 
 
 		 139 aa  157  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0498  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.43 
 
 		 139 aa  157  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0144132 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1414  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50 
 
 		 143 aa  155  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276842  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4937  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  50.69 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0889323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5742  Cytosine deaminase  47.22 
 
 		 144 aa  149  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.55 
 
 		 160 aa  147  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1204  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.92 
 
 		 143 aa  147  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3674  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.11 
 
 		 154 aa  143  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3606  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.11 
 
 		 154 aa  143  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241267  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3601  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  52.11 
 
 		 154 aa  143  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00422327  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0892  cytosine deaminase  55.56 
 
 		 176 aa  143  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2579  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.39 
 
 		 146 aa  140  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.7 
 
 		 164 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2066  Cytosine deaminase  49.3 
 
 		 165 aa  136  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3461  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.89 
 
 		 150 aa  133  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0824  cytosine deaminase  55 
 
 		 140 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.385917  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04267  cytosine deaminase  48.59 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5409  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.210093  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05950  cytosine deaminase, putative  44.44 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275444  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1819  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein, putative  39.86 
 
 		 172 aa  93.6  7e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000174201  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0400  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.73 
 
 		 168 aa  90.9  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000750433  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.21 
 
 		 148 aa  88.6  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1229  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.97 
 
 		 156 aa  87.4  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  46.08 
 
 		 150 aa  83.6  8e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.85 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0501  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.59 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1284  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.09 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  48.42 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.16 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.906022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1413  tRNA-adenosine deaminase  34.51 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3893  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.67 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.21 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.04 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.04 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  37.14 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4222  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.11 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  46.88 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4304  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.86 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0110494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0760  hypothetical protein  37.59 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.46 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.59 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.98 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0190  cytosine deaminase, putative  34.72 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  43.16 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.26 
 
 		 181 aa  77.4  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.3 
 
 		 168 aa  77  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0232  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  41.05 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0819594  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.71 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.26 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  43.75 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  42.71 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  36.11 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  40.69 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1942  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.43 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1525  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.62 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04155  putative cytosine/adenosine deaminase  33.58 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.411988  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  32.58 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0668  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.57 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  42.71 
 
 		 177 aa  73.6  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0274  tRNA-adenosine deaminase  41.24 
 
 		 168 aa  73.6  0.0000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  35.21 
 
 		 187 aa  73.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  35.21 
 
 		 200 aa  73.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0325  tRNA-adenosine deaminase  39.58 
 
 		 170 aa  73.6  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00296157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>