More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3674 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3606  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 		 154 aa  318  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241267  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3601  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  100 
 
 		 154 aa  318  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00422327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3674  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 		 154 aa  318  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2579  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  79.86 
 
 		 146 aa  248  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  78.77 
 
 		 164 aa  245  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2066  Cytosine deaminase  72.79 
 
 		 165 aa  226  8e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04267  cytosine deaminase  67.86 
 
 		 151 aa  206  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205672  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3461  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  67.86 
 
 		 150 aa  206  8e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5409  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  65.13 
 
 		 158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.210093  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1123  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.08 
 
 		 147 aa  163  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1204  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.23 
 
 		 143 aa  163  9e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0498  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.57 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0144132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0485  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.57 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4937  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  55.32 
 
 		 143 aa  161  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0889323 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1414  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.19 
 
 		 143 aa  161  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276842  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5742  Cytosine deaminase  52.82 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.54 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.68 
 
 		 274 aa  155  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0117  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.03 
 
 		 145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.515188 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0677  cytosine deaminase  50.68 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1480  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.48 
 
 		 145 aa  151  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1816  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.35 
 
 		 144 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468453  normal  0.80703 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2556  cytosine deaminase  56.03 
 
 		 149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1786  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.66 
 
 		 145 aa  150  7e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315123  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1435  Cytosine deaminase  56.94 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.317365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1980  cytosine deaminase  51.05 
 
 		 145 aa  148  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.597926  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1635  cytosine deaminase  49.3 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.503034  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4158  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.77 
 
 		 160 aa  147  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0892  cytosine deaminase  56.92 
 
 		 176 aa  147  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4144  cytosine deaminase  55.24 
 
 		 154 aa  146  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3776  cytosine deaminase  49.3 
 
 		 145 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.650074  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0051  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.89 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0945  cytosine deaminase  48.23 
 
 		 177 aa  143  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353729  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1602  cytosine deaminase  51.06 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0907  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  52.11 
 
 		 146 aa  143  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.459324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.55 
 
 		 145 aa  140  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3869  cytosine deaminase  46.81 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0725206  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1307  cytosine deaminase  50.35 
 
 		 145 aa  137  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1483  Cytosine deaminase  46.48 
 
 		 146 aa  137  6e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2798  cytosine deaminase  46.53 
 
 		 145 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2881  cytosine deaminase  46.53 
 
 		 145 aa  135  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2977  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.53 
 
 		 145 aa  135  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1397  cytosine deaminase  45.83 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1290  Cytosine deaminase  46.53 
 
 		 145 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.589706 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3086  cytosine deaminase  46.53 
 
 		 145 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78481  cytosine deaminase  46.1 
 
 		 150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.701177  normal  0.798696 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3229  cytosine deaminase  46.53 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3077  cytosine deaminase  46.53 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1204  cytosine deaminase  45.14 
 
 		 145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0824  cytosine deaminase  52.14 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.385917  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00990  cytosine/adenosine deaminase  45.07 
 
 		 175 aa  127  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2506  cytosine deaminase  45.07 
 
 		 149 aa  127  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0043356  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1318  hypothetical protein  42.76 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0864  Cytosine deaminase  45.07 
 
 		 165 aa  120  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05950  cytosine deaminase, putative  38.71 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275444  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1603  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.62 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0633824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.87 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2030  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.14 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000721347  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0888  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.09 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0741  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  35.09 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  35.05 
 
 		 159 aa  67  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1686  hypothetical protein  31.88 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1685  hypothetical protein  31.88 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  30.99 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0501  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.08 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  29.5 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.33 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  31.08 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  40 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1340  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  35.79 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.296989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  30 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.43 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  32.14 
 
 		 222 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.73 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  32.62 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  28.78 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2788  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.95 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0654304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.7 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0328  cytosine deaminase  34.75 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775757  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0169  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.58 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000421684 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0300  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.75 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.018226  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.06 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.62 
 
 		 175 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  30.13 
 
 		 176 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1317  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  32.76 
 
 		 175 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  34.74 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.62 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.86 
 
 		 175 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1609  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.11 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0448042  normal  0.295189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  31.76 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.66 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  32.48 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  33.8 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4304  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.91 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0110494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.91 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36880  tRNA-adenosine deaminase  33.02 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.699352  normal  0.0665453 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  34.38 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1216  tRNA-adenosine deaminase  34.13 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  34.38 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>