More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1318 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1318  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  313  7e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4158  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  63.64 
 
 		 160 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1480  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.34 
 
 		 145 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3869  cytosine deaminase  62.07 
 
 		 145 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0725206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.94 
 
 		 145 aa  194  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1980  cytosine deaminase  60.84 
 
 		 145 aa  191  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.597926  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3776  cytosine deaminase  58.62 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.650074  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1602  cytosine deaminase  59.31 
 
 		 145 aa  188  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3086  cytosine deaminase  57.93 
 
 		 145 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1290  Cytosine deaminase  57.93 
 
 		 145 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.589706 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2506  cytosine deaminase  60 
 
 		 149 aa  186  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0043356  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3077  cytosine deaminase  57.93 
 
 		 145 aa  186  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3229  cytosine deaminase  57.93 
 
 		 145 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1483  Cytosine deaminase  59.44 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1635  cytosine deaminase  57.93 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.503034  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2977  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  57.93 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2798  cytosine deaminase  57.24 
 
 		 145 aa  184  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0907  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  58.22 
 
 		 146 aa  184  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.459324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2881  cytosine deaminase  57.24 
 
 		 145 aa  184  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1397  cytosine deaminase  56.55 
 
 		 145 aa  183  8e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1204  cytosine deaminase  57.24 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0117  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.55 
 
 		 145 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.515188 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1786  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.55 
 
 		 145 aa  177  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315123  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0677  cytosine deaminase  55.86 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1307  cytosine deaminase  58.04 
 
 		 145 aa  173  8e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0945  cytosine deaminase  54.67 
 
 		 177 aa  172  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353729  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0051  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.42 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2556  cytosine deaminase  53.06 
 
 		 149 aa  170  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4144  cytosine deaminase  56.55 
 
 		 154 aa  167  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1816  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.72 
 
 		 144 aa  167  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468453  normal  0.80703 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1414  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.15 
 
 		 143 aa  161  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276842  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78481  cytosine deaminase  55.63 
 
 		 150 aa  160  6e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.701177  normal  0.798696 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00990  cytosine/adenosine deaminase  50 
 
 		 175 aa  159  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.04 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5742  Cytosine deaminase  50.34 
 
 		 144 aa  157  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1435  Cytosine deaminase  51.77 
 
 		 153 aa  157  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.317365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4937  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  50.35 
 
 		 143 aa  157  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0889323 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0892  cytosine deaminase  54.2 
 
 		 176 aa  156  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1123  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.98 
 
 		 147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.3 
 
 		 274 aa  153  8e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0498  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.23 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0144132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0485  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.23 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1204  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.83 
 
 		 143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0864  Cytosine deaminase  46.76 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05950  cytosine deaminase, putative  48.67 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275444  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0824  cytosine deaminase  53.9 
 
 		 140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.385917  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2579  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.33 
 
 		 146 aa  130  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.44 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04267  cytosine deaminase  46.85 
 
 		 151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205672  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2066  Cytosine deaminase  42.47 
 
 		 165 aa  128  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3674  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.76 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3606  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.76 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241267  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3601  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  42.76 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00422327  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3461  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.95 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1229  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.92 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5409  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.66 
 
 		 158 aa  94.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.210093  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  46.88 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1819  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein, putative  42 
 
 		 172 aa  87.4  6e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000174201  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  42.16 
 
 		 163 aa  87.4  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  44.21 
 
 		 154 aa  87  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.39 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.16 
 
 		 181 aa  84.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  42.11 
 
 		 168 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0400  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  41 
 
 		 168 aa  84.3  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000750433  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.07 
 
 		 148 aa  84.3  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  43.3 
 
 		 177 aa  84  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  45.92 
 
 		 171 aa  84.3  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.16 
 
 		 157 aa  84  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0327  putative deaminase  45.74 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.26 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.18 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.24 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.16 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.21 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.21 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0501  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.17 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.16 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  42.27 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  42.11 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.62 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  39.18 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.09 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.906022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4222  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.24 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  39 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.33 
 
 		 484 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.72 
 
 		 361 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.72 
 
 		 361 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45 
 
 		 475 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.58 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0325  tRNA-adenosine deaminase  40.62 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00296157  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0065  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  47.44 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3893  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.58 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  40 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.05 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.05 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0109  cytosine/adenosine deaminase  38.78 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  36.36 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0738  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.01 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000176793  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  38.71 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.78 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>