More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4055 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 		 164 aa  336  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2579  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  87.59 
 
 		 146 aa  269  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3606  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  78.77 
 
 		 154 aa  245  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241267  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3601  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  78.77 
 
 		 154 aa  245  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00422327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3674  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  78.77 
 
 		 154 aa  245  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3461  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  67.79 
 
 		 150 aa  214  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2066  Cytosine deaminase  69.5 
 
 		 165 aa  211  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04267  cytosine deaminase  65.1 
 
 		 151 aa  205  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5409  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  68.49 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.210093  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.82 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1786  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.47 
 
 		 145 aa  157  5e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315123  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4144  cytosine deaminase  56.85 
 
 		 154 aa  157  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0117  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.47 
 
 		 145 aa  157  8e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.515188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4937  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  51.77 
 
 		 143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0889323 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1204  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50 
 
 		 143 aa  154  6e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0677  cytosine deaminase  52.08 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5742  Cytosine deaminase  48.59 
 
 		 144 aa  153  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1123  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.35 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1980  cytosine deaminase  53.85 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.597926  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1397  cytosine deaminase  50.69 
 
 		 145 aa  150  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1635  cytosine deaminase  49.31 
 
 		 145 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.503034  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2556  cytosine deaminase  55.32 
 
 		 149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1290  Cytosine deaminase  50.69 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.589706 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.43 
 
 		 274 aa  150  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3086  cytosine deaminase  50.69 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1480  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.06 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2798  cytosine deaminase  50 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2881  cytosine deaminase  50 
 
 		 145 aa  148  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1816  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.89 
 
 		 144 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468453  normal  0.80703 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1414  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  48.23 
 
 		 143 aa  148  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276842  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0498  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.86 
 
 		 139 aa  148  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0144132 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3077  cytosine deaminase  50.69 
 
 		 145 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0485  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.86 
 
 		 139 aa  148  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3229  cytosine deaminase  50 
 
 		 145 aa  147  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3869  cytosine deaminase  47.22 
 
 		 145 aa  147  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0725206  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1204  cytosine deaminase  50 
 
 		 145 aa  147  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2977  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.31 
 
 		 145 aa  147  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1435  Cytosine deaminase  53.15 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.317365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0945  cytosine deaminase  48.97 
 
 		 177 aa  145  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353729  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.3 
 
 		 145 aa  145  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0892  cytosine deaminase  54.2 
 
 		 176 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1483  Cytosine deaminase  48.95 
 
 		 146 aa  143  8.000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3776  cytosine deaminase  47.55 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.650074  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1602  cytosine deaminase  47.55 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4158  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.18 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0051  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.14 
 
 		 146 aa  142  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1307  cytosine deaminase  50.35 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0907  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50.7 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.459324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2506  cytosine deaminase  47.55 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0043356  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78481  cytosine deaminase  45.77 
 
 		 150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.701177  normal  0.798696 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00990  cytosine/adenosine deaminase  45.07 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1318  hypothetical protein  44.44 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0864  Cytosine deaminase  44.76 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0824  cytosine deaminase  51.43 
 
 		 140 aa  124  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.385917  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05950  cytosine deaminase, putative  42.48 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275444  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  31.97 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 		 174 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36880  tRNA-adenosine deaminase  32.64 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.699352  normal  0.0665453 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.01 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0501  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.66 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  33.33 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2031  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.21 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2030  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.11 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000721347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2788  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.07 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0654304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1603  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0633824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  29.5 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5985  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.35 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.755307  normal  0.455465 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.87 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1686  hypothetical protein  32.87 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1685  hypothetical protein  32.87 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4304  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.48 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0110494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  32.89 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0798  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.85 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0400  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  32.12 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000750433  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1609  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.76 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0448042  normal  0.295189 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  33.33 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  28.06 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  37.5 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.04 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.04 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  28.85 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  31.65 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  35.77 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.51 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0174432  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  35.71 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.86 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.86 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.28 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  32.58 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0208  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.57 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.672477  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.74 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  31.79 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.76 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  33.56 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.95 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  31.65 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0169  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.24 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000421684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.89 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  31.58 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.6 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>