More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1123 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1123  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
147 aa  306  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0498  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  87.05 
 
 
139 aa  258  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0144132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0485  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  87.05 
 
 
139 aa  258  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1816  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  81.12 
 
 
144 aa  250  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468453  normal  0.80703 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4937  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  80.99 
 
 
143 aa  246  9e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0889323 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1414  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  79.58 
 
 
143 aa  240  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276842  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1204  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  74.83 
 
 
143 aa  233  7e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  72.34 
 
 
274 aa  226  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5742  Cytosine deaminase  65.73 
 
 
144 aa  211  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0824  cytosine deaminase  71.22 
 
 
140 aa  195  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.385917  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3086  cytosine deaminase  62.07 
 
 
145 aa  187  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1290  Cytosine deaminase  62.07 
 
 
145 aa  187  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.589706 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2798  cytosine deaminase  60.69 
 
 
145 aa  186  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2881  cytosine deaminase  60.69 
 
 
145 aa  185  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1204  cytosine deaminase  61.38 
 
 
145 aa  185  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3229  cytosine deaminase  61.38 
 
 
145 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3077  cytosine deaminase  61.38 
 
 
145 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1397  cytosine deaminase  60 
 
 
145 aa  184  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2977  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  60 
 
 
145 aa  184  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1635  cytosine deaminase  59.31 
 
 
145 aa  183  6e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.503034  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0945  cytosine deaminase  55.7 
 
 
177 aa  179  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353729  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1483  Cytosine deaminase  56.94 
 
 
146 aa  178  2.9999999999999997e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1307  cytosine deaminase  56.25 
 
 
145 aa  176  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4158  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.56 
 
 
160 aa  173  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3776  cytosine deaminase  53.79 
 
 
145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.650074  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1480  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.86 
 
 
145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2556  cytosine deaminase  53.15 
 
 
149 aa  169  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1602  cytosine deaminase  53.79 
 
 
145 aa  168  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1786  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.63 
 
 
145 aa  168  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315123  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0117  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.63 
 
 
145 aa  167  4e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.515188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3461  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.38 
 
 
150 aa  167  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3869  cytosine deaminase  54.48 
 
 
145 aa  167  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0725206  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0051  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.79 
 
 
146 aa  166  9e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04267  cytosine deaminase  52.38 
 
 
151 aa  165  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205672  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1980  cytosine deaminase  53.47 
 
 
145 aa  165  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.597926  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0677  cytosine deaminase  54.23 
 
 
145 aa  164  4e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3674  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.08 
 
 
154 aa  163  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3601  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  52.08 
 
 
154 aa  163  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00422327  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3606  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.08 
 
 
154 aa  163  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241267  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0907  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  52.03 
 
 
146 aa  161  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.459324  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.39 
 
 
145 aa  159  9e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2579  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.06 
 
 
146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1318  hypothetical protein  46.98 
 
 
151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.35 
 
 
164 aa  152  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2506  cytosine deaminase  48.28 
 
 
149 aa  151  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0043356  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2066  Cytosine deaminase  46.62 
 
 
165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78481  cytosine deaminase  47.89 
 
 
150 aa  149  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.701177  normal  0.798696 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.09 
 
 
160 aa  148  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4144  cytosine deaminase  46.85 
 
 
154 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1435  Cytosine deaminase  46.94 
 
 
153 aa  144  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.317365  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5409  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.52 
 
 
158 aa  140  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.210093  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0892  cytosine deaminase  46.92 
 
 
176 aa  138  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00990  cytosine/adenosine deaminase  41.84 
 
 
175 aa  131  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0864  Cytosine deaminase  39.46 
 
 
165 aa  123  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05950  cytosine deaminase, putative  40 
 
 
165 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275444  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.01 
 
 
156 aa  101  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  43.18 
 
 
137 aa  97.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.36 
 
 
148 aa  97.1  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4304  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.57 
 
 
160 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0110494  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  47.62 
 
 
148 aa  94.7  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  47.62 
 
 
148 aa  94.7  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  36.42 
 
 
182 aa  94.7  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0400  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  39.86 
 
 
168 aa  92.8  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000750433  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0501  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.49 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.76 
 
 
175 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.76 
 
 
175 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.32 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.76 
 
 
175 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  36.17 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.13 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.74 
 
 
154 aa  88.2  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1819  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein, putative  39.16 
 
 
172 aa  87.8  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000174201  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  38.57 
 
 
150 aa  87.4  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.76 
 
 
174 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  37.06 
 
 
164 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  40.95 
 
 
193 aa  87.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.67 
 
 
166 aa  87.4  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  36.43 
 
 
161 aa  87  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.26 
 
 
177 aa  86.7  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1603  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.92 
 
 
161 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0633824  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  39.09 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1229  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30 
 
 
156 aa  86.3  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  36.62 
 
 
172 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  36.62 
 
 
172 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0017  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.97 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.29 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  36.24 
 
 
190 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  35.92 
 
 
172 aa  84.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  35.34 
 
 
149 aa  84.7  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  35.92 
 
 
172 aa  84.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  41.75 
 
 
200 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  41.75 
 
 
187 aa  84.3  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  35.92 
 
 
172 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  41.75 
 
 
200 aa  84.7  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.9 
 
 
164 aa  84.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1712  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.36 
 
 
167 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.344098  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  36.62 
 
 
169 aa  84  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.95 
 
 
189 aa  84  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  40.95 
 
 
222 aa  84  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  34.51 
 
 
167 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>