More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3461 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3461  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 		 150 aa  311  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04267  cytosine deaminase  88 
 
 		 151 aa  281  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205672  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  67.79 
 
 		 164 aa  214  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2579  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  70.92 
 
 		 146 aa  213  9e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3606  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  67.86 
 
 		 154 aa  206  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241267  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3601  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  67.86 
 
 		 154 aa  206  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00422327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3674  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  67.86 
 
 		 154 aa  206  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2066  Cytosine deaminase  64.14 
 
 		 165 aa  190  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5409  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.59 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.210093  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1123  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.38 
 
 		 147 aa  167  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5742  Cytosine deaminase  51.06 
 
 		 144 aa  164  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1816  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.48 
 
 		 144 aa  157  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468453  normal  0.80703 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0485  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.71 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1204  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.35 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0498  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.71 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0144132 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1414  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50.36 
 
 		 143 aa  152  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276842  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4937  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  51.43 
 
 		 143 aa  150  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0889323 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.55 
 
 		 160 aa  150  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.71 
 
 		 274 aa  148  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3869  cytosine deaminase  49.65 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0725206  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0892  cytosine deaminase  54.2 
 
 		 176 aa  147  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0945  cytosine deaminase  50 
 
 		 177 aa  147  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353729  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1635  cytosine deaminase  47.55 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.503034  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3776  cytosine deaminase  47.92 
 
 		 145 aa  144  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.650074  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.95 
 
 		 145 aa  144  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4158  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4144  cytosine deaminase  51.39 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1602  cytosine deaminase  48.61 
 
 		 145 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1480  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.65 
 
 		 145 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00990  cytosine/adenosine deaminase  47.65 
 
 		 175 aa  139  9e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1290  Cytosine deaminase  48.25 
 
 		 145 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.589706 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3086  cytosine deaminase  48.25 
 
 		 145 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3077  cytosine deaminase  48.25 
 
 		 145 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2556  cytosine deaminase  50.35 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1435  Cytosine deaminase  49.67 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.317365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0117  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.15 
 
 		 145 aa  135  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.515188 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1786  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.15 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315123  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3229  cytosine deaminase  47.55 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0051  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.66 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2798  cytosine deaminase  47.55 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2881  cytosine deaminase  47.55 
 
 		 145 aa  134  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1980  cytosine deaminase  46.48 
 
 		 145 aa  134  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.597926  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1397  cytosine deaminase  47.55 
 
 		 145 aa  133  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0907  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.89 
 
 		 146 aa  133  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.459324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2977  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.55 
 
 		 145 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1307  cytosine deaminase  48.23 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1204  cytosine deaminase  47.55 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2506  cytosine deaminase  46.15 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0043356  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0677  cytosine deaminase  44.06 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78481  cytosine deaminase  45.77 
 
 		 150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.701177  normal  0.798696 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1318  hypothetical protein  42.95 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0824  cytosine deaminase  49.29 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.385917  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0864  Cytosine deaminase  46.85 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1483  Cytosine deaminase  42.25 
 
 		 146 aa  123  9e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05950  cytosine deaminase, putative  42.28 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275444  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  35.67 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1603  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.96 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0633824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.06 
 
 		 190 aa  72  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2030  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000721347  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.58 
 
 		 174 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  34.72 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  34.72 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1609  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.78 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0448042  normal  0.295189 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  34.72 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1686  hypothetical protein  38.83 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1685  hypothetical protein  38.83 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  34.72 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  34.72 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  33.33 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  34.85 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 		 157 aa  67  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0208  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.46 
 
 		 190 aa  67  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.672477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  37.14 
 
 		 159 aa  67  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.89 
 
 		 176 aa  66.6  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.64 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0325  tRNA-adenosine deaminase  34.78 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00296157  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.89 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.89 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  36.27 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  31.29 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5985  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.64 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.755307  normal  0.455465 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0501  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.96 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  34.29 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.05 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.76 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.89 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  31.39 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.89 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  31.94 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0169  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.04 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000421684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  26.53 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.87 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  31.94 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  31.94 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1340  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  34.74 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.296989 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  31.94 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36880  tRNA-adenosine deaminase  30.07 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.699352  normal  0.0665453 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  31.94 
 
 		 178 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0017  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.02 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2788  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.2 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0654304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>