More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5409 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5409  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 		 158 aa  317  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.210093  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2579  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  72.03 
 
 		 146 aa  214  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3601  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  65.13 
 
 		 154 aa  210  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00422327  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3606  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  65.13 
 
 		 154 aa  210  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241267  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3674  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  65.13 
 
 		 154 aa  210  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  68.03 
 
 		 164 aa  209  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2066  Cytosine deaminase  67.81 
 
 		 165 aa  207  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3461  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.59 
 
 		 150 aa  194  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04267  cytosine deaminase  58.11 
 
 		 151 aa  184  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205672  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4937  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  49.3 
 
 		 143 aa  157  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0889323 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1123  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.52 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1414  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.77 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276842  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1204  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.89 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0945  cytosine deaminase  47.5 
 
 		 177 aa  147  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353729  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0498  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.43 
 
 		 139 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0144132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0485  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.43 
 
 		 139 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2556  cytosine deaminase  52.45 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4144  cytosine deaminase  52.41 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1816  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.77 
 
 		 144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468453  normal  0.80703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5742  Cytosine deaminase  41.55 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78481  cytosine deaminase  48.59 
 
 		 150 aa  140  6e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.701177  normal  0.798696 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1307  cytosine deaminase  53.19 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0907  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.39 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.459324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1435  Cytosine deaminase  52.08 
 
 		 153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.317365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1290  Cytosine deaminase  46.53 
 
 		 145 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.589706 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3086  cytosine deaminase  46.53 
 
 		 145 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0117  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.83 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.515188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2798  cytosine deaminase  46.53 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2881  cytosine deaminase  46.53 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1397  cytosine deaminase  45.83 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.24 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1635  cytosine deaminase  44.06 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.503034  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2977  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.53 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1786  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.14 
 
 		 145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315123  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3229  cytosine deaminase  45.83 
 
 		 145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0892  cytosine deaminase  51.54 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3077  cytosine deaminase  45.83 
 
 		 145 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.44 
 
 		 274 aa  133  8e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1480  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.83 
 
 		 145 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1483  Cytosine deaminase  46.48 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1204  cytosine deaminase  45.14 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.55 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4158  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.18 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3776  cytosine deaminase  44.06 
 
 		 145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.650074  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0677  cytosine deaminase  42.76 
 
 		 145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1980  cytosine deaminase  48.25 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.597926  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3869  cytosine deaminase  43.36 
 
 		 145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0725206  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0864  Cytosine deaminase  47.92 
 
 		 165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0051  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.71 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1602  cytosine deaminase  42.66 
 
 		 145 aa  127  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00990  cytosine/adenosine deaminase  47.3 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2506  cytosine deaminase  45.58 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0043356  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0824  cytosine deaminase  48.57 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.385917  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1318  hypothetical protein  37.86 
 
 		 151 aa  103  9e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05950  cytosine deaminase, putative  34.21 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275444  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  40.27 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.41 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.68 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1603  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.83 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0633824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.03 
 
 		 168 aa  72  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.67 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1686  hypothetical protein  35.04 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1685  hypothetical protein  33.1 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.51 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15680  hypothetical protein  39.06 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0652995  hitchhiker  0.000000000000295358 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2788  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.27 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0654304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0208  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.31 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.672477  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  34.51 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  36.48 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1349  hypothetical protein  38.28 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  37.5 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.55 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1609  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0448042  normal  0.295189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36880  tRNA-adenosine deaminase  36.36 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.699352  normal  0.0665453 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3417  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.81 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.5 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  35.29 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.16 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0174432  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0202  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.48 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.48 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  28.87 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0017  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.09 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  35.56 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  30.77 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.33 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0277  tRNA-adenosine deaminase  45.26 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681033  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  34.53 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  33.33 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0798  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.22 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  33.54 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4829  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.05 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0469  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.73 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176891  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0501  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.63 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  34.53 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  30.99 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9319  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.92 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.66 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  35.16 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.13 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>