More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2506 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2506  cytosine deaminase  100 
 
 
149 aa  308  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0043356  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  74.31 
 
 
145 aa  221  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1480  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  71.53 
 
 
145 aa  220  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1980  cytosine deaminase  68.75 
 
 
145 aa  219  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.597926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1602  cytosine deaminase  68.28 
 
 
145 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3869  cytosine deaminase  67.59 
 
 
145 aa  210  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0725206  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3776  cytosine deaminase  66.21 
 
 
145 aa  206  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.650074  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4158  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  66.67 
 
 
160 aa  206  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1483  Cytosine deaminase  65.97 
 
 
146 aa  206  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2977  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  64.14 
 
 
145 aa  203  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1397  cytosine deaminase  64.14 
 
 
145 aa  203  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0907  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  64.58 
 
 
146 aa  203  8e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.459324  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2798  cytosine deaminase  63.45 
 
 
145 aa  202  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2881  cytosine deaminase  63.45 
 
 
145 aa  202  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1290  Cytosine deaminase  62.07 
 
 
145 aa  201  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.589706 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3086  cytosine deaminase  62.07 
 
 
145 aa  201  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3077  cytosine deaminase  62.07 
 
 
145 aa  201  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3229  cytosine deaminase  62.07 
 
 
145 aa  200  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1204  cytosine deaminase  62.76 
 
 
145 aa  200  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1307  cytosine deaminase  66.67 
 
 
145 aa  197  6e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1635  cytosine deaminase  60.69 
 
 
145 aa  192  1e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.503034  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00990  cytosine/adenosine deaminase  63.12 
 
 
175 aa  192  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1318  hypothetical protein  60 
 
 
151 aa  186  7e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0117  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.31 
 
 
145 aa  186  9e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.515188 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1786  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.62 
 
 
145 aa  186  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315123  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78481  cytosine deaminase  61.97 
 
 
150 aa  185  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.701177  normal  0.798696 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0945  cytosine deaminase  60.4 
 
 
177 aa  183  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353729  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0677  cytosine deaminase  57.93 
 
 
145 aa  183  7e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0051  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.17 
 
 
146 aa  183  8e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2556  cytosine deaminase  59.44 
 
 
149 aa  181  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4144  cytosine deaminase  59.57 
 
 
154 aa  179  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1435  Cytosine deaminase  56.74 
 
 
153 aa  174  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.317365  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0864  Cytosine deaminase  55.63 
 
 
165 aa  170  7.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1816  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.1 
 
 
144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468453  normal  0.80703 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.75 
 
 
274 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5742  Cytosine deaminase  51.03 
 
 
144 aa  159  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1123  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.28 
 
 
147 aa  151  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1414  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  49.31 
 
 
143 aa  151  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276842  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1204  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.9 
 
 
143 aa  148  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4937  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  47.22 
 
 
143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0889323 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0485  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.81 
 
 
139 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0498  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.81 
 
 
139 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0144132 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2066  Cytosine deaminase  47.92 
 
 
165 aa  141  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.87 
 
 
160 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05950  cytosine deaminase, putative  47.65 
 
 
165 aa  137  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.55 
 
 
164 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0892  cytosine deaminase  48.85 
 
 
176 aa  134  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2579  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.95 
 
 
146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3461  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.15 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3674  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.07 
 
 
154 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3601  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  45.07 
 
 
154 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00422327  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3606  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.07 
 
 
154 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241267  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04267  cytosine deaminase  43.06 
 
 
151 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205672  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0824  cytosine deaminase  49.65 
 
 
140 aa  121  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.385917  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5409  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.22 
 
 
158 aa  114  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.210093  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.66 
 
 
148 aa  90.1  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0400  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  39.29 
 
 
168 aa  88.6  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000750433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  44.33 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  47.37 
 
 
166 aa  87  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.87 
 
 
151 aa  86.7  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1819  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein, putative  35.86 
 
 
172 aa  86.7  9e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000174201  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5296  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  47.37 
 
 
166 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000172102  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1229  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.71 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.26 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4222  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.29 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.32 
 
 
160 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.37 
 
 
165 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4304  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.1 
 
 
160 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0110494  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0019  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  46.32 
 
 
166 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0510921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0020  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  46.32 
 
 
166 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  46.32 
 
 
166 aa  84.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  46.32 
 
 
166 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.736614  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  46.32 
 
 
166 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  46.32 
 
 
166 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0024  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  46.32 
 
 
166 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000145543  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0501  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.49 
 
 
149 aa  84.3  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.16 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.37 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  34.62 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3893  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.75 
 
 
161 aa  82  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.26 
 
 
164 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0616301  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  44.21 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.11 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.26 
 
 
161 aa  80.1  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.92 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0232  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  42.11 
 
 
157 aa  79  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0819594  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.27 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.27 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.32 
 
 
181 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0017  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.75 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3440  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.18 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0325  tRNA-adenosine deaminase  42.71 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00296157  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0760  hypothetical protein  36.36 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.75 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1065  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.01 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  36.23 
 
 
150 aa  76.6  0.00000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.95 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.906022  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  37.86 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  44.21 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0274  tRNA-adenosine deaminase  40 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>