More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4158 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4158  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 		 160 aa  328  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  79.31 
 
 		 145 aa  244  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1480  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  77.93 
 
 		 145 aa  240  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3869  cytosine deaminase  76.39 
 
 		 145 aa  239  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0725206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1980  cytosine deaminase  73.79 
 
 		 145 aa  235  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.597926  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3776  cytosine deaminase  75.69 
 
 		 145 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.650074  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0907  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  75 
 
 		 146 aa  229  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.459324  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1602  cytosine deaminase  75 
 
 		 145 aa  224  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1483  Cytosine deaminase  67.12 
 
 		 146 aa  213  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1397  cytosine deaminase  68.75 
 
 		 145 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0117  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  65.97 
 
 		 145 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.515188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2798  cytosine deaminase  68.06 
 
 		 145 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1290  Cytosine deaminase  68.06 
 
 		 145 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.589706 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2881  cytosine deaminase  68.06 
 
 		 145 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3086  cytosine deaminase  68.06 
 
 		 145 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1307  cytosine deaminase  68.97 
 
 		 145 aa  210  5.999999999999999e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1786  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.58 
 
 		 145 aa  210  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315123  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2977  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  68.06 
 
 		 145 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3077  cytosine deaminase  68.06 
 
 		 145 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1204  cytosine deaminase  67.36 
 
 		 145 aa  208  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1635  cytosine deaminase  65.28 
 
 		 145 aa  208  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.503034  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3229  cytosine deaminase  67.36 
 
 		 145 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2506  cytosine deaminase  66.67 
 
 		 149 aa  206  7e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0043356  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0677  cytosine deaminase  65.97 
 
 		 145 aa  206  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0051  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  61.11 
 
 		 146 aa  204  4e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1318  hypothetical protein  63.64 
 
 		 151 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0945  cytosine deaminase  62.84 
 
 		 177 aa  196  7.999999999999999e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353729  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4144  cytosine deaminase  66.67 
 
 		 154 aa  190  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2556  cytosine deaminase  60.42 
 
 		 149 aa  186  9e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1435  Cytosine deaminase  61.97 
 
 		 153 aa  183  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.317365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00990  cytosine/adenosine deaminase  57.75 
 
 		 175 aa  183  9e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78481  cytosine deaminase  60.28 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.701177  normal  0.798696 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1123  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.56 
 
 		 147 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1816  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.94 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468453  normal  0.80703 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1414  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  56.94 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276842  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.56 
 
 		 274 aa  169  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4937  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  55.56 
 
 		 143 aa  167  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0889323 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.33 
 
 		 160 aa  167  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0864  Cytosine deaminase  54.67 
 
 		 165 aa  167  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5742  Cytosine deaminase  53.47 
 
 		 144 aa  166  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1204  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.47 
 
 		 143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0498  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.29 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0144132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0485  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.29 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0892  cytosine deaminase  58.02 
 
 		 176 aa  156  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3606  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.77 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241267  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3601  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  51.77 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00422327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3674  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.77 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3461  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 		 150 aa  145  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2579  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.94 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.18 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05950  cytosine deaminase, putative  48.61 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275444  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04267  cytosine deaminase  48.59 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205672  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2066  Cytosine deaminase  46.48 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0824  cytosine deaminase  54.29 
 
 		 140 aa  125  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.385917  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5409  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.77 
 
 		 158 aa  121  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.210093  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1819  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein, putative  39.13 
 
 		 172 aa  98.6  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000174201  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1229  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.46 
 
 		 156 aa  97.4  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.04 
 
 		 157 aa  96.3  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0400  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  41.67 
 
 		 168 aa  96.3  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000750433  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.18 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3893  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.81 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.42 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.54 
 
 		 181 aa  87  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.32 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  38.3 
 
 		 177 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4222  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.57 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  36.43 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0760  hypothetical protein  36.81 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  46.32 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.72 
 
 		 150 aa  84.3  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.906022  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  32.89 
 
 		 182 aa  84.3  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  36.3 
 
 		 166 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.736614  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.31 
 
 		 161 aa  84  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  43.14 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.33 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0019  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  36.73 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0510921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0020  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  36.73 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  36.73 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1603  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.36 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0633824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  36.73 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125537  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  43.75 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  36.73 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0325  tRNA-adenosine deaminase  45.26 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00296157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0024  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  36.73 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000145543  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.26 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  42.86 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0274  tRNA-adenosine deaminase  45 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1284  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.05 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0501  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.87 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  35.17 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  44 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  32.88 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  46.23 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  34.93 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  40.21 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.58 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  35 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  35 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.27 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>