189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0134 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 118 aa  243  6e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  81.25 
 
 		 137 aa  191  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  62.71 
 
 		 121 aa  152  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  59.32 
 
 		 120 aa  146  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  62.39 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  63.48 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  57.63 
 
 		 119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.22 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  45 
 
 		 177 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.1 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  27.59 
 
 		 120 aa  67  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  36.63 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.27 
 
 		 274 aa  63.5  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01320  hypothetical protein  37.61 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333196  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.56 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  30.53 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0577  hypothetical protein  40.23 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116523  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.51 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.15 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  31.19 
 
 		 135 aa  52  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  37.36 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3001  cupin 2 domain-containing protein  33.02 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1270  hypothetical protein  33.75 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  29.47 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  32.39 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  31.33 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  27.37 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 		 151 aa  50.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1757  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.44 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  27.03 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0901  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.554615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1350  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 287 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.832765  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.82 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  27.43 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  36.46 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  38.33 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  27.03 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.38 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  29.89 
 
 		 115 aa  48.1  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2134  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  35.94 
 
 		 464 aa  47.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000409972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18490  mannose-6-phosphate isomerase  29.91 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.151918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0888  mannose-1-phosphate guanylyltransferase-like  32.81 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  hitchhiker  0.000147914 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  37.04 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17330  cupin domain-containing protein  28.87 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017863  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.64 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 182 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  36.62 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.63 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.332449  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.84 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  32.89 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.39 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0523242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1285  cupin region  30.12 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.03 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  36.76 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.44 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3512  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.39 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1723  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.59 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.410123  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  26.47 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5005  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.92 
 
 		 255 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 182 aa  45.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  35.71 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1167  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168838 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.92 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3273  methionyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 662 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.15 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1915  cupin 2 domain-containing protein  27.71 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  28.74 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2328  cupin region  32 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.56 
 
 		 190 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  27.78 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  37.31 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.26 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.28 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0016  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose- 6-phosphate isomerase  28.12 
 
 		 447 aa  44.3  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  35.71 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  31.65 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  31.43 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  31.07 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  32 
 
 		 191 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  31.88 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  26.37 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6135  hypothetical protein  38.1 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.715074  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2852  cupin 2  26.32 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  33.82 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.88 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4209  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.39 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2366  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  28.85 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.47 
 
 		 421 aa  42.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4843  cupin 2 domain-containing protein  34.18 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>