29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0801 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 122 aa  253  8e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.332449  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0577  hypothetical protein  57.85 
 
 		 125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116523  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01320  hypothetical protein  49.18 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333196  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  46.34 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.45 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.38 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  39.6 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1757  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.65 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.23 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.93 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  39.6 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  32.18 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  31.82 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.63 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6792  cupin 2 domain-containing protein  34.94 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.518208 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5748  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.83 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.63 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1646  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.68 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3259  cupin 2 domain-containing protein  29.63 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115338  normal  0.0903256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32560  Conserved hypothetical cupin family protein  33.73 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157773  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0766  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.14 
 
 		 472 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04818  cupin domain  29.91 
 
 		 141 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.04 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  34.57 
 
 		 115 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3999  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  29.17 
 
 		 476 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0945  hypothetical protein  26.51 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0114637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38060  hypothetical protein  31.63 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  36.23 
 
 		 298 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0788  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.67 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>