84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0837 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
130 aa  270  7e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.99 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.65 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3867  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468547  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.03 
 
 
146 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  32.58 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  28.09 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.95 
 
 
121 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  39.34 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  32.5 
 
 
177 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1285  cupin region  27.55 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  27.78 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2053  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.87 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03110  hypothetical protein  34.15 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.050196  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.69 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  41.67 
 
 
155 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.07 
 
 
121 aa  47.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  46.51 
 
 
155 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  29.75 
 
 
155 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  29.35 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  29.21 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.63 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.83 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.18 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  28.72 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  27.5 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.67 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  29.75 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1177  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  26.83 
 
 
171 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  29.41 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  35.59 
 
 
171 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.21 
 
 
186 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38 
 
 
126 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.28 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.61 
 
 
172 aa  43.9  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.74 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3674  cupin 2 domain-containing protein  30.11 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.206207  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.29 
 
 
192 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4208  Methionine--tRNA ligase  34.92 
 
 
645 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0857223  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 
104 aa  42.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.23 
 
 
274 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.47 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.94 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.51 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.84 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0433  dioxygenase, ARD/ARD' family  39.66 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  39.53 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2004  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.7 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0595  Acireductone dioxygenase ARD  39.66 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.415363  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  31.75 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1804  cupin 2 domain-containing protein  35.94 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  28.57 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2267  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  31.75 
 
 
472 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  32.2 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.51 
 
 
138 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  28.87 
 
 
154 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  33.77 
 
 
141 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  32.79 
 
 
123 aa  42  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  38.1 
 
 
159 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.12 
 
 
125 aa  41.2  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.59 
 
 
170 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
174 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  26.92 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  36.96 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  29.69 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.26 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.67 
 
 
135 aa  40.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  26.09 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 
197 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  45 
 
 
333 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2662  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  43.18 
 
 
332 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 
332 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.36 
 
 
114 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3525  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.74 
 
 
136 aa  40  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  29.51 
 
 
134 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>