89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1608 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 104 aa  214  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  88.24 
 
 		 108 aa  186  9e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  30.61 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  33.73 
 
 		 120 aa  52  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  33.73 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  33.73 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  33.73 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  33.73 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  33.73 
 
 		 120 aa  52  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  33.73 
 
 		 120 aa  52  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  33.73 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  33.73 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  33.73 
 
 		 120 aa  52  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  31.33 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  35.37 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4317  polyketide synthesis domain protein  30.49 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4469  polyketide synthesis domain-containing protein  30.49 
 
 		 116 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4402  polyketide synthesis domain-containing protein  29.27 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.155389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4399  polyketide synthesis domain protein  29.27 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4287  polyketide synthesis domain protein  29.27 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  37.14 
 
 		 283 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 361 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  29.63 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 361 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1915  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 361 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  33.33 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.07 
 
 		 192 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 255 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  36.76 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  33.33 
 
 		 172 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  31.51 
 
 		 361 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  31.51 
 
 		 356 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  32 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.58 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  29.58 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  34.43 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2476  cupin 2 domain-containing protein  31.88 
 
 		 334 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.73 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  30.67 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.81 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  29.21 
 
 		 373 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2100  cupin region  37.88 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2610  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 199 aa  44.3  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  24.76 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  33.78 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  33.78 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2919  hypothetical protein  30.65 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000876891  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 		 130 aa  42.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18080  cupin domain-containing protein  27.87 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.259998  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.84 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.78 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.78 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.36 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  36.84 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3175  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.74 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  29.23 
 
 		 372 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  31.51 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  39.29 
 
 		 343 aa  42  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.37 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1270  hypothetical protein  28.36 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3499  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.74 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  33.33 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  27.14 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1734  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.88 
 
 		 455 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  32.26 
 
 		 155 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3670  cupin 2 domain-containing protein  28.99 
 
 		 351 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.38 
 
 		 153 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471134  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2799  hypothetical protein  28.92 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7832900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.76 
 
 		 167 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3145  cupin 2 domain-containing protein  28.99 
 
 		 351 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.03 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  34 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.03 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03110  hypothetical protein  26.67 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.050196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1759  hypothetical protein  24.71 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0905  cupin 2 domain-containing protein  26.97 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.52502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  30.38 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1685  cupin 2 domain-containing protein  32.81 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  30.16 
 
 		 342 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  30.86 
 
 		 172 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.51 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08490  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.27 
 
 		 105 aa  40  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  30.16 
 
 		 342 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>