69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2476 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2476  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 334 aa  686    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3670  cupin 2 domain-containing protein  80.67 
 
 		 351 aa  551  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3145  cupin 2 domain-containing protein  78.31 
 
 		 351 aa  545  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2454  cupin 2 domain-containing protein  73.49 
 
 		 351 aa  511  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  72.51 
 
 		 345 aa  482  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0738  cupin 2 domain-containing protein  56.57 
 
 		 349 aa  387  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  53.94 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  52.65 
 
 		 283 aa  296  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  36.52 
 
 		 364 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  36.09 
 
 		 345 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  36.09 
 
 		 345 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  36.09 
 
 		 345 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  35.47 
 
 		 342 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  35.78 
 
 		 345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  35.78 
 
 		 345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  35.17 
 
 		 342 aa  196  6e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  37.39 
 
 		 370 aa  192  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  33.84 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.54 
 
 		 364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  34.23 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  34.86 
 
 		 348 aa  183  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  37.05 
 
 		 353 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  37.04 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  37.42 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1087  gentisate 1,2-dioxygenase oxidoreductase protein  37.39 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  37.39 
 
 		 347 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  37.39 
 
 		 347 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  34.23 
 
 		 344 aa  179  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  37.39 
 
 		 347 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  37.35 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  36.22 
 
 		 348 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  36.22 
 
 		 348 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.33 
 
 		 370 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  37.08 
 
 		 347 aa  175  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55211  predicted protein  32.83 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.110005 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  36.47 
 
 		 348 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  34.04 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  35.37 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  33.93 
 
 		 353 aa  169  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.24 
 
 		 374 aa  169  9e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  30.75 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57210  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.37 
 
 		 350 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0819  gentisate 1,2-dioxygenase  34.78 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  34.16 
 
 		 373 aa  159  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2910  cupin 2 protein  31.63 
 
 		 357 aa  157  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305706  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4214  cupin 2 domain-containing protein  33.14 
 
 		 387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  31.34 
 
 		 377 aa  156  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  31.55 
 
 		 372 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1825  putative dioxygenase oxidoreductase protein  33.64 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.113884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3565  cupin 2, barrel  31.86 
 
 		 367 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1387  cupin 2, barrel  32.82 
 
 		 379 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3243  gentisate 1,2-dioxygenase  33.13 
 
 		 368 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.39318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0655  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.23 
 
 		 377 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  31.85 
 
 		 370 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0167  cupin 2 domain-containing protein  31.16 
 
 		 365 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 361 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  31.58 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 361 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  30.92 
 
 		 361 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0280  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.66 
 
 		 363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  28.57 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  31.06 
 
 		 255 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  23.7 
 
 		 178 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  30.49 
 
 		 181 aa  47.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.88 
 
 		 104 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4263  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  28.26 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  31.88 
 
 		 108 aa  43.1  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>