85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2964 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 160 aa  328  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  48 
 
 		 190 aa  141  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.04 
 
 		 165 aa  110  9e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.99 
 
 		 204 aa  107  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.99 
 
 		 204 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.73 
 
 		 192 aa  104  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  35.62 
 
 		 163 aa  87  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  34.69 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.33 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.67 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  32.28 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.93 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  33.66 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  30 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  28.86 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.88 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.64 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  29.31 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  30.7 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.66 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.85 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1355  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.46 
 
 		 195 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.646374  normal  0.0330672 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  33.04 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.38 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  25.34 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  34.38 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0378  cupin region  30.56 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930622  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  32.97 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5084  cupin superfamily protein  37.04 
 
 		 147 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259637  normal  0.536671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  30.84 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  32.97 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  32.97 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  27.7 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  32.97 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  25.64 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.52 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.16 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  28.32 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  28.46 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  29.13 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.58 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  30.43 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  30.1 
 
 		 191 aa  48.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  24.14 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  31.43 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  29.13 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  26.25 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  20.93 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.66 
 
 		 181 aa  47.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  27.7 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  31.96 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  36.84 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.36 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  30.1 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2572  cupin 2 domain-containing protein  37.31 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1350  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 287 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.832765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.56 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3187  hypothetical protein  39.13 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00572816  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4297  cupin 2 domain-containing protein  32.29 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.72 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  35.48 
 
 		 121 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  26.89 
 
 		 338 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  26.61 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3060  cupin domain protein  28.24 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  26.51 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.87 
 
 		 118 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1633  cupin 2 domain-containing protein  28.75 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  28.21 
 
 		 189 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3067  cupin 2 domain-containing protein  25.55 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.67 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0454  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.5 
 
 		 356 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 134 aa  41.2  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  32.91 
 
 		 148 aa  40.8  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  31.63 
 
 		 372 aa  40.8  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.33 
 
 		 172 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>