61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3067 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3067  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 145 aa  298  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  77.93 
 
 		 145 aa  239  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  35.11 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.8 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.85 
 
 		 192 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  29.25 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.7 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.17 
 
 		 159 aa  50.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.3 
 
 		 165 aa  50.4  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.47 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.37 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.32 
 
 		 377 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  23.97 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26 
 
 		 204 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26 
 
 		 204 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0025  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.51 
 
 		 97 aa  47  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  31.18 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  30.12 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  31.52 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  31.03 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.41 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.89 
 
 		 169 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  30.38 
 
 		 338 aa  44.7  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  35 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.17 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  31 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  28.95 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  27.1 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.18 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  27.05 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  29.89 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  29.89 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.67 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  29.89 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  25.58 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  29.89 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1340  N-acetylneuraminate synthase  24.21 
 
 		 521 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00426215  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  36.23 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  29.89 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  29.89 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  29.89 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  29.89 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.45 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 186 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  36.23 
 
 		 186 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  36.23 
 
 		 186 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  36.23 
 
 		 186 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.55 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  36.23 
 
 		 186 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  28.68 
 
 		 135 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2878  N-acetylneuraminic acid synthase domain protein  38.18 
 
 		 497 aa  41.2  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2209  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000991087  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  25.47 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.73 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.63 
 
 		 108 aa  40.4  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2465  hypothetical protein  28.99 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0296269  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 197 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4578  cupin 2 domain-containing protein  32.31 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753369 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  29.17 
 
 		 132 aa  40  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>