75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3113 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 174 aa  353  5.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.86 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.62 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.21 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  40.86 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.25 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.05 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  32.7 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  36.96 
 
 		 163 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  36.11 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.64 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.62 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  31.76 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.62 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.96 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.15 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.67 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  33.93 
 
 		 141 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.7 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0454  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.27 
 
 		 356 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.34 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  29.27 
 
 		 163 aa  51.6  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.56 
 
 		 166 aa  51.2  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  32.11 
 
 		 190 aa  51.2  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.19 
 
 		 389 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  27.36 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.61 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  28.1 
 
 		 338 aa  47.4  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0737  cupin 2 domain-containing protein  31.45 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  29.36 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  25.66 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  36.51 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1355  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.18 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.646374  normal  0.0330672 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  44.44 
 
 		 114 aa  45.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  26.04 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  31.82 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1700  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.792463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  28.43 
 
 		 149 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  27.91 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3304  signal peptide protein  38.98 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0282721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  31.63 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5448  cupin 2, barrel  33.73 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.708388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  31.67 
 
 		 108 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5845  cupin 2 domain-containing protein  33.73 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1941  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  37.04 
 
 		 185 aa  42  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.385308 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  30.69 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  34.44 
 
 		 150 aa  42  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.84 
 
 		 163 aa  42  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.61 
 
 		 377 aa  42  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.29 
 
 		 110 aa  41.6  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.29 
 
 		 110 aa  41.6  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2610  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.91 
 
 		 199 aa  42  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 130 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  26.74 
 
 		 119 aa  41.6  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2347  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204857  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3067  cupin 2 domain-containing protein  25.47 
 
 		 145 aa  41.6  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1414  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  37.04 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1509  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  37.04 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2326  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  37.04 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1823  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  37.04 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706879 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01276  DNA-binding transcriptional repressor  37.04 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1535  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  37.04 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01287  hypothetical protein  37.04 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.17 
 
 		 184 aa  41.2  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  36.36 
 
 		 155 aa  40.8  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  39.66 
 
 		 180 aa  40.8  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1985  cupin domain protein  37.21 
 
 		 83 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>