49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3501 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 184 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.17 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  35.29 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  29.8 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.97 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1355  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.47 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.646374  normal  0.0330672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  29.92 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  34.41 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  33.67 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  33.67 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  33.67 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  31.86 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.48 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  30.88 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  26.95 
 
 		 163 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.12 
 
 		 135 aa  51.2  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  32.65 
 
 		 139 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  31.63 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.08 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.3 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.09 
 
 		 156 aa  48.5  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  31.78 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.01 
 
 		 149 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.68 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.09 
 
 		 204 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  28.08 
 
 		 153 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 135 aa  44.7  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.09 
 
 		 204 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.16 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.38 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.44 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.07 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.14 
 
 		 159 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  28.44 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  33.7 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  33.7 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  33.7 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  33.7 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  33.7 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1700  cupin 2 domain-containing protein  33.7 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.792463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  33.7 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.67 
 
 		 181 aa  42  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  31.19 
 
 		 163 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.35 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.21 
 
 		 159 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  36.17 
 
 		 174 aa  41.2  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>