60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4239 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 163 aa  334  3.9999999999999995e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  44.16 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.27 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.17 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  32.37 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  34.55 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.17 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.46 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.46 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  30.5 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  31.5 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.4 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.89 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1355  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.06 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.646374  normal  0.0330672 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.54 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.21 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  23.85 
 
 		 189 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  37.38 
 
 		 190 aa  50.8  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.84 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3060  cupin 2 domain-containing protein  35.16 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.82 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.58 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.75 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.45 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.97 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.08 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.08 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  27.87 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  26.87 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  27.19 
 
 		 135 aa  44.3  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 148 aa  44.3  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  31.17 
 
 		 163 aa  43.9  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  32.99 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  28.43 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  28.43 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 208 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  28.43 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 208 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 208 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  37.14 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  30.6 
 
 		 145 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.33 
 
 		 136 aa  42  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4857  cupin domain-containing protein  34.78 
 
 		 157 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0286871 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  27.45 
 
 		 182 aa  41.6  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.31 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3067  cupin 2 domain-containing protein  29.73 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  37.14 
 
 		 159 aa  40.8  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.06 
 
 		 152 aa  40.8  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 182 aa  40.8  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>