89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4857 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4857  cupin domain-containing protein  100 
 
 		 157 aa  330  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0286871 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  59.09 
 
 		 159 aa  177  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3146  cupin 2 protein  54.61 
 
 		 160 aa  174  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0747  hypothetical protein  57.72 
 
 		 160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  50.97 
 
 		 157 aa  167  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2501  hypothetical protein  51.66 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.61 
 
 		 160 aa  165  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2355  hypothetical protein  51.66 
 
 		 161 aa  164  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3086  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.67 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.097702  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2981  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.68 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2894  cupin 2 domain-containing protein  48.08 
 
 		 159 aa  148  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.32 
 
 		 156 aa  143  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02768  cupin region  52.71 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  44.3 
 
 		 159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.21 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  41.86 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  38.41 
 
 		 154 aa  97.1  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4561  cupin 2 domain-containing protein  43.05 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  39.04 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  41.18 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  40.95 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  40.2 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  40.2 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  40.2 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  36.11 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  35.48 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2020  cupin 2, barrel  30.41 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434776 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.43 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.43 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  34.43 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  38.24 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  34.43 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  36.45 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  36.45 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  32.5 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  34.58 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  34.82 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  38.24 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  32.41 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  38.24 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  36.27 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  36.27 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  36.27 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  36.27 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  36.27 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  36.27 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  33.05 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  37 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  30.25 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  38.03 
 
 		 333 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  29.81 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.21 
 
 		 332 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.21 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2440  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 220 aa  51.2  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086441  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  38.24 
 
 		 179 aa  50.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  29.03 
 
 		 171 aa  50.8  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  27.27 
 
 		 332 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.26 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  26.12 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3880  cupin 2, barrel  29.13 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0904  hypothetical protein  29.03 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  25.69 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.04 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  27.12 
 
 		 188 aa  44.7  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 176 aa  44.3  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  24.74 
 
 		 172 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4943  cupin 2 domain-containing protein  26.88 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637992  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3425  cupin 2, barrel  26.88 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5343  cupin 2 domain-containing protein  26.88 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499051  normal  0.0476873 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  27.72 
 
 		 108 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.42 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.42 
 
 		 172 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  26.42 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1596  mannose-6-phosphate isomerase, type II  28.23 
 
 		 134 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0737  cupin 2 domain-containing protein  32.93 
 
 		 207 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 		 163 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.53 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.82 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 179 aa  41.2  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 194 aa  41.2  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2755  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28.71 
 
 		 476 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  29.09 
 
 		 197 aa  40.8  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1044  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 212 aa  40.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0507985  normal  0.081223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  25.78 
 
 		 167 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4476  oxalate decarboxylase  28.85 
 
 		 418 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.867974 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 		 197 aa  40.4  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>