85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1315 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
163 aa  336  9.999999999999999e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  40.85 
 
 
174 aa  132  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  43.75 
 
 
162 aa  128  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1917  hypothetical protein  42.77 
 
 
172 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  40.24 
 
 
172 aa  121  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  42.68 
 
 
172 aa  120  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  37.43 
 
 
172 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.62 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0814  cupin 2 protein  42.86 
 
 
173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.64 
 
 
172 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  38.27 
 
 
167 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  36.99 
 
 
171 aa  110  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  37.04 
 
 
167 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  42.19 
 
 
171 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.41 
 
 
172 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  37.04 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.62 
 
 
172 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.18 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.18 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.85 
 
 
158 aa  79  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  39.22 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.46 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.16 
 
 
158 aa  72  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.85 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  35.24 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  36.07 
 
 
372 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  41.75 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  34.95 
 
 
190 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  28.08 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  24.53 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  29.77 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.89 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  37.25 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  33.61 
 
 
170 aa  62.4  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3626  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 
159 aa  61.6  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  31.09 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  35.71 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  37.25 
 
 
155 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  37.25 
 
 
155 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.4 
 
 
160 aa  57.8  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
159 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  35.92 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  35.92 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  35.92 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  35.29 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  29.06 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  30.61 
 
 
170 aa  52  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  28.93 
 
 
167 aa  51.2  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.34 
 
 
332 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4857  cupin domain-containing protein  26.12 
 
 
157 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0286871 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  34.34 
 
 
332 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  33.98 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  33.98 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  33.98 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  33.98 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  29.32 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  30 
 
 
159 aa  48.1  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.92 
 
 
152 aa  47.8  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  29.46 
 
 
166 aa  47.8  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  32.98 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0602591  normal  0.755419 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  33.01 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  33.01 
 
 
160 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2020  cupin 2, barrel  25.53 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434776 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 
333 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3146  cupin 2 protein  27.52 
 
 
160 aa  45.1  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.14 
 
 
126 aa  44.7  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0747  hypothetical protein  26.5 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02768  cupin region  26.45 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 
151 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3060  cupin 2 domain-containing protein  32.76 
 
 
149 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975792 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2501  hypothetical protein  28.57 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2355  hypothetical protein  28.57 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  28.8 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 
141 aa  41.6  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  32.53 
 
 
119 aa  41.6  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  31.52 
 
 
155 aa  40.8  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  26.39 
 
 
108 aa  40.8  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>