36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0121 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 141 aa  296  6e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  45.83 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0441  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.68 
 
 		 132 aa  130  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0545  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.29 
 
 		 131 aa  123  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0997  cupin 2 domain-containing protein  44.62 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138878 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0851  mate efflux family protein  48.08 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0817404  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5434  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.95 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 		 152 aa  50.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.4 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.73 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5139  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.1 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.94 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0698  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.26 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.793931  normal  0.732081 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  26.8 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  35.82 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.87 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  35.62 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1589  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.31 
 
 		 132 aa  43.9  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.908983 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  31.17 
 
 		 152 aa  43.5  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.59 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.34 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  37.74 
 
 		 172 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  35.9 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  34.29 
 
 		 332 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1689  hypothetical protein  39.66 
 
 		 235 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.34 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0680  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.51 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00734165  normal  0.352119 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  36 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1917  hypothetical protein  37.74 
 
 		 172 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.67 
 
 		 156 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 190 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4418  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.85 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  31.51 
 
 		 121 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>