70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0814 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0814  cupin 2 protein  100 
 
 
173 aa  350  4e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1917  hypothetical protein  68.26 
 
 
172 aa  216  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  68.07 
 
 
172 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  61.82 
 
 
174 aa  204  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  40.96 
 
 
172 aa  139  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  46.81 
 
 
171 aa  140  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  45.86 
 
 
172 aa  131  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  39.88 
 
 
162 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 
163 aa  122  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.32 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.36 
 
 
172 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.42 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.82 
 
 
172 aa  117  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  45.39 
 
 
171 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.88 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  40.88 
 
 
167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.12 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  40.26 
 
 
167 aa  111  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.17 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.69 
 
 
166 aa  108  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  40.94 
 
 
166 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3626  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.37 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  32.77 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.88 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  31.48 
 
 
161 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  31.78 
 
 
161 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.78 
 
 
161 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.48 
 
 
161 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  31.9 
 
 
152 aa  62.4  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.51 
 
 
145 aa  59.7  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0602591  normal  0.755419 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  38 
 
 
172 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  28.23 
 
 
190 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  33.96 
 
 
155 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  33.96 
 
 
155 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  34.21 
 
 
160 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  34.21 
 
 
153 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  34.21 
 
 
153 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  34 
 
 
155 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  29.86 
 
 
372 aa  52.4  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  33 
 
 
155 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  33 
 
 
155 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  33 
 
 
155 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  28.26 
 
 
167 aa  52  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  36.84 
 
 
161 aa  50.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  33 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  32.69 
 
 
157 aa  49.3  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.17 
 
 
160 aa  47.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  30.21 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  22.16 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.28 
 
 
159 aa  45.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  32.67 
 
 
151 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  25.23 
 
 
151 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  24.41 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1593  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.57 
 
 
138 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.147547 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.98 
 
 
126 aa  42  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 
141 aa  41.6  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0441  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.89 
 
 
132 aa  41.2  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0400  cupin 2 domain-containing protein  38.96 
 
 
129 aa  41.2  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  30.61 
 
 
332 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2020  cupin 2, barrel  29.11 
 
 
155 aa  41.2  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434776 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.52 
 
 
332 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0904  hypothetical protein  29.52 
 
 
160 aa  40.8  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>