64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2193 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
171 aa  343  7e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.31 
 
 
158 aa  149  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.09 
 
 
166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.59 
 
 
158 aa  136  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  43.92 
 
 
171 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.24 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.57 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0814  cupin 2 protein  44.44 
 
 
173 aa  108  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  42.64 
 
 
172 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1917  hypothetical protein  37.89 
 
 
172 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  36.59 
 
 
174 aa  99.8  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  35.21 
 
 
171 aa  87  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  35.88 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  29.68 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  35.43 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  29.2 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  34.07 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  30.65 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  27.74 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0602591  normal  0.755419 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  27.82 
 
 
158 aa  61.2  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3626  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 
159 aa  58.2  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  25.49 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.23 
 
 
167 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.63 
 
 
172 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 
161 aa  50.8  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  33.93 
 
 
151 aa  50.8  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  32.29 
 
 
161 aa  50.8  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.15 
 
 
154 aa  50.8  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 
161 aa  50.8  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  32.29 
 
 
161 aa  50.8  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1874  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.935294 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  30.43 
 
 
154 aa  48.5  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  31.19 
 
 
152 aa  47.8  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 
190 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  27.68 
 
 
155 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  29.59 
 
 
152 aa  44.7  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 
170 aa  44.7  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  27.68 
 
 
155 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2709  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.71 
 
 
126 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2878  N-acetylneuraminic acid synthase domain protein  30.97 
 
 
497 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  34.52 
 
 
333 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  41.86 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3499  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.9 
 
 
161 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.09 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  31.48 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3175  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.9 
 
 
161 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20235  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  27.68 
 
 
172 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  27.68 
 
 
155 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
332 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  27.68 
 
 
155 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  34.85 
 
 
139 aa  42  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  27.68 
 
 
155 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2020  cupin 2, barrel  30.26 
 
 
155 aa  41.6  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.9 
 
 
377 aa  41.2  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 
137 aa  41.2  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  27.68 
 
 
155 aa  40.8  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  27.88 
 
 
155 aa  40.8  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3304  signal peptide protein  43.9 
 
 
155 aa  40.8  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0282721  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 
119 aa  40.8  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>