98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0971 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
166 aa  335  9.999999999999999e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  65.82 
 
 
158 aa  227  5e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  63.75 
 
 
158 aa  214  5.9999999999999996e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.09 
 
 
171 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.75 
 
 
172 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.06 
 
 
172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  47.66 
 
 
171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0814  cupin 2 protein  42.54 
 
 
173 aa  104  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  40.31 
 
 
172 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1917  hypothetical protein  39.53 
 
 
172 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  39.55 
 
 
174 aa  97.1  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
158 aa  95.1  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  34.03 
 
 
171 aa  87.4  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  32.7 
 
 
167 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  34.75 
 
 
172 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  32.08 
 
 
167 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  36.23 
 
 
172 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  30.95 
 
 
166 aa  80.5  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  34.56 
 
 
166 aa  79  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  34.06 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3626  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.56 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  31.9 
 
 
154 aa  77  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.65 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0602591  normal  0.755419 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  29.69 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  35.85 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  35.92 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.92 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.92 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  35.92 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  32.73 
 
 
153 aa  67  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  31.45 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.75 
 
 
172 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.09 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  35.96 
 
 
172 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  35.4 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  32.77 
 
 
154 aa  62  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  34.51 
 
 
155 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  34.51 
 
 
155 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  35.42 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  35.4 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  35.4 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  35.4 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  34.31 
 
 
155 aa  58.9  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 
154 aa  58.9  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  36.63 
 
 
159 aa  58.9  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  30.83 
 
 
154 aa  57.4  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0747  hypothetical protein  37.78 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  31.45 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3146  cupin 2 protein  35.56 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  29.41 
 
 
332 aa  54.3  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
160 aa  53.9  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  33.65 
 
 
333 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  33.66 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.37 
 
 
332 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3086  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.64 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.097702  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2894  cupin 2 domain-containing protein  39.77 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  30.89 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2981  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.64 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  35.16 
 
 
159 aa  52  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  35.16 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18080  cupin domain-containing protein  44.16 
 
 
116 aa  51.6  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.259998  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.87 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  31.43 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  30.1 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  31.43 
 
 
160 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  31.43 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  31.43 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.87 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  26.32 
 
 
170 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  29.79 
 
 
167 aa  47.4  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  30.48 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  36.56 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02768  cupin region  28.89 
 
 
129 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.23 
 
 
103 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  30.48 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.67 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.09 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3525  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 
136 aa  46.6  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2355  hypothetical protein  32.58 
 
 
161 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.73 
 
 
115 aa  45.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2501  hypothetical protein  32.58 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2020  cupin 2, barrel  30.49 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434776 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  34.44 
 
 
259 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  34.44 
 
 
259 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  34.44 
 
 
259 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  24.56 
 
 
372 aa  45.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  41.67 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  26.09 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
286 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  35.14 
 
 
458 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.68 
 
 
114 aa  42  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
281 aa  41.6  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1575  DNA-binding protein  32.26 
 
 
249 aa  41.2  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1565  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5343  cupin 2 domain-containing protein  28.24 
 
 
160 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499051  normal  0.0476873 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4943  cupin 2 domain-containing protein  28.24 
 
 
160 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637992  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3425  cupin 2, barrel  28.24 
 
 
160 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2941  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 
271 aa  40.4  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0631546  normal  0.420407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>